西尼罗病毒E蛋白的B细胞表位预测.docVIP

西尼罗病毒E蛋白的B细胞表位预测 　　【摘要】目的：预测西尼罗病毒E蛋白的B 细胞表位。方法：根据西尼罗病毒E蛋白基因组序列，采用Kyte-Doolittle 的亲水性方案、Emini 方案和Jameson-Wolf 抗原指数方案，辅以对E蛋白的二级结构中的柔性区域的分析，预测西尼罗病毒E蛋白的B 细胞表位。结果：最后推测西尼罗病毒E蛋白的B细胞表位最有可能位于N端第35-42，147-156，191-198，226-249，329-337，375-382区段，另外E蛋白N端第275-284，313-320，396-403区段也可能存在B细胞表位。结论：应用多参数预测E蛋白的B 细胞表位，为进一步研究西尼罗病毒的蛋白特征、研制疫苗和制备单克隆抗体奠定了基础。 　　【关键词】西尼罗病毒；E蛋白；B 细胞表位 　　【中图分类号】R373.9 【文献标识码】A 【文章编号】2095-685106-0-01 　　1.材料与方法 　　1.1 西尼罗病毒Chin-01株E蛋白氨基酸序列 　　根据西尼罗病毒Chin-01株基因序列推导出E蛋白氨基酸序列，共有501个氨基酸残基。 　　1.2 西尼罗病毒E蛋白的二级结构预测 　　采用Garnier-Robson方案、Chou-Fasman方案和Karplus-Schulz方案预测蛋白质的二级结构，各参数的意义参见文献[1]。 　　1