分子标记辅助选择育种教学教材.pptVIP

分子标记辅助选择育种 ;一、概念：;二、分子标记的优点;三、分子标记种类;（二）基于PCR的分子标记 1. 随机引物PCR标记： RAPD（randomly amplified polymorphic DNA ，PCR 随机扩增基因组DNA多态性）标记； ISSR（inter-simple sequence repeats，简单重复序列间区多态性）标记。 ;（2）特异引物PCR标记： SSR (simple sequence repeats，简单序列重复，微卫星 ) 标记； STS (sequence tagged-site，序列标签位点 ) 标记； DD-PCR (differential display PCR，差异显示PCR ) 标记。 ;PCR procedure;Cycle 2 4 分子; ; 技术：;RAPD (Randomly Amplified Polymorphism DNA);4.3 SSR 标记; SSR标记 ; Simple Sequence Repeats － SSR ;A 9 repeats;40; 优点： 高多态性； SSR位点在染色体上分布均匀； 引物具有一定的通用性； 共显性标记； 缺点： 可用的位点数目少 ； 设计引物的费用高，耗时长； 物种专一性； 引物的开发有一定难度。;SSR引物在大豆中的扩增谱带; Simple Sequence Repeats －SSR;4.5 ISSR标记（Inter-simple sequence repeats）;4.6 SSCP (单链构象的多态性) (Single Strand Conformation Polymorphism);SSCP (单链构象的多型性) (Single Strand Conformation Polymorphism);MNAAAAAAAAAAA;DD-PCR ( 基于PCR的差异显示 ) ;技术：; 技术：;AFLP技术流程;;优点： 只需要极少量的DNA模板； 不需要Southern杂交； 不需要预先知道DNA的序列信息； 重复性好，可快速获得大量信息。缺点：受专利保护;51; ;五、分子标记在生物技术中的应用;2.遗传多样性和物种亲缘关系;3.利用DNA分子标记可以鉴别品种，评估 品种纯度;4.育种中的分子标记辅助选择; 第二节 重要农艺性基因连锁标记的筛选技术;一、MAS育种的分子标记具备的条件 1.分子标记与目标基因紧密连锁 2.标记适用性强,重复性好,经济简便的检测大量个体 3.不同遗传背景选择有效;二、遗传图谱构建与重要农艺性状基因的标记;1、构建遗传图谱的意义： 确定不同分子标记在染色体上的相对位置或排列情况，为作物种质资源收集、目标基因定位、基因克隆、育种规模大小及相应育种方法的确定等提供理论依据。但是，由于分子标记数目的限制，目前作图亲本的选用首先考虑亲本间的多态性水平，育种目标性状考虑较少。;大豆SSR图谱;66;第二同源群遗传连锁图;2、遗传作图的原理 与经典连锁检测一致，即基于染色体的交换与重组 用重组率来表示基因间的遗传距离。;3、遗传图谱构建的主要环节;4、用于分子标记的遗传作图群体;Mardler×百农3217的近等基因系;;?确定育种性状 确定有极端差异的亲本 构建遗传分离群体 表型分析遗传分离群体 分子标记鉴定基因型 构建分子连锁图谱 获得与目标性状紧密连锁的分子标记;基 因 的 分 子 标 记 定 位;1. NIL（Near-isogenic lines）分析法的原理： 如果一对近等基因系在目标性状上表现差异，那么凡是能在这对近等基因系之间揭示多态性的分子标记就可能位于目标基因的附近。 因此利用NIL材料，可以寻找与目标基因紧密连锁的分子标记。;基本步骤： 1）筛选与目标基因连锁的分子标记：利用分子标记技术分析一对近等基因系，筛选在两者间表现出多态性的引物或探针。 2）进行标记与目的基因连锁的验证：利用多态性标记/探针对近等基因系间杂交分离群体中的单株进行筛选，确定每个单株的标记基因型。同步对分离群体中单株的目标