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《生物化学》内部资料 第2章 核酸的化学

2.1 核酸的概念与重要性 1869年Miescher从细胞核中分离出核素nuclein)。 1889年Altman制备了核酸(nucleic acid)。 1930~40年,Kossel Levene等确定核酸的的组分: 2.1 核酸的概念与重要性 2.2 核酸的组成成分 核酸完全水解产物产生嘌呤和嘧啶等碱性物质、戊糖(核糖或脱氧核糖)和核酸的混合物。 核酸部分水解则产生核苷和核苷酸。每个核苷分子含一分子碱基和一分子戊糖,一分子核苷酸部分水解产生核苷外和,还有一分子磷酸。核酸的各种水解产物可用层析或电泳等方法分离鉴定。 2.2.1 核糖和脱氧核糖 RNA和DNA两类核酸是因所含的戊糖不同而分类的。RNA含D-核糖和DNA含D-2-脱氧核糖。某些RNA中含有少量的D-2-O-甲基核糖,即核糖的第2个碳原子上的羟基已甲基化。核酸分子中的戊糖是β-D-型。 2.2.1 核糖和脱氧核糖 2.2.2 嘌呤碱和嘧啶碱 两类核酸所含的主要碱基都是4种。它们所含的两种嘌呤碱完全相同,即腺嘌呤和鸟嘌呤。RNA和DNA所含的嘧啶碱有所不同。RNA主要含胞嘧啶和尿嘧啶,大多数DNA也含胞嘧啶,但不含尿嘧啶而以胸腺嘧啶(5-甲基尿嘧啶)代之。在某些类型的DNA中,5-甲基胞嘧啶可在一定限度内取代胞嘧啶。5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶可看作是胞嘧啶经化学修饰的产物,属于修饰胞嘧啶。 有些核酸还存在少量其它修饰碱基。由于这些修饰碱基通常含量很少,所以也称为微量碱基或稀有碱基。 2.2.2 嘌呤碱和嘧啶碱 2.2.2 嘌呤碱和嘧啶碱 含氧的碱基有烯醇式和酮式两种互变异构体,在生理pH条件下主要以酮式存在。体内核酸大分子中的碱基也已酮式存在。 尿嘧啶的互变异构作用如下式: 2.2.2 嘌呤碱和嘧啶碱 碱基可用英文名称的前3个字母表示,也可以用英文名称的第一个字母表示。 2.2.2 嘌呤碱 与嘧啶碱 2.2.3 核苷 核苷是核糖或脱氧核糖与嘌呤碱或嘧啶碱生成的糖苷。糖的第1碳原子(C1’)通常与嘌呤碱的第9氮原子或嘧啶碱的第1氮原子相连。 核苷用单字符号(A、G、C、U)表示;脱氧核苷则在单字符号前面加一个小写的d(dA、dG、dC、dU)表示。 2.2.4 核苷酸 核苷酸是核苷的磷酸酯。核苷酸的核糖有3个自由的羟基,可以磷酸酯化分别生成2’-,3’-和5’-核苷酸。脱氧核苷酸的糖上只有2个自由羟基,只能生成3’-和5’-脱氧核苷酸,各种核苷酸的结构已经由有机合成法证实。 2.2.5 核苷酸的连接方式 构成核酸大分子的基本单位是核苷酸。 实验证明,RNA和DNA都是没有分支的多核苷酸长链。链中每个核苷酸的3’-羟基和相邻核苷酸的戊糖上的5’-磷酸相连。因此,核苷酸间的连接键是3’,5’-磷酸二酯键,由相间排列的戊糖和磷酸构成核酸大分子的主链,而代表其特性的碱基则可以看成是有次序地连接在其主链的侧链基团。 主链上的磷酸基是酸性的,在细胞的pH条件下带负电荷;而嘌呤和嘧啶碱基因相对不溶于水而具有疏水性质。 另外,由于所有核苷酸间的磷酸二酯键有相同的走向, RNA和DNA链都有特殊的方向性,而每条线形核酸链都有一个5’-末端和一个3’末端。 2.3 DNA的结构 DNA是由数量庞大的四种脱氧核苷酸通过3’,5’-磷酸二酯键连接而成的,DNA的一级结构就是指这些脱氧核苷酸在分子中的排列顺序(序列)。 2.3.2 DNA的双螺旋二级结构 DNA的双螺旋结构模型是Watson和Crick于1953年提出的。 2.3.3 DNA的三级结构 DNA双螺旋进一步扭曲即构成三级结构。 双链DNA多为线形分子,但某些病毒、细菌质粒、真核生物的线粒体和叶绿体,及某些细菌的染色体DNA为双链环状DNA。在生物体内,绝大多数的双链环状DNA(dcDNA)可进一步扭曲成超螺旋。 2.3.3 DNA的三级结构 超螺旋DNA具有更为致密的结构,可以将很长的DNA分子压缩在一个较小的体积内,且由于其密度较大,在离心场中和凝胶电泳中的移动速度亦较快。 2.4 DNA和基因组 生物体内的遗传特征是由DNA中特定的核苷酸序列决定的。DNA通过自我复制合成出完全相同的分子,从而将遗传信息由亲代传到子代。 生物体可将碱基配对的方式合成与DNA核苷酸序列相对应的RNA,这一过程称为转录。转录生成的RNA一部分用于指导蛋白质合成,称为信使RNA(mRNA)。mRNA的核苷酸序列决定蛋白质氨基酸序列,由mRNA指导蛋白质合成的过程称为翻译。蛋白质是在核糖体合成的,核糖体中所含的RNA称为核糖体RNA(rRNA),转移RNA(tRNA)的功能是将氨基酸转运到核糖体的特定部位用于蛋白质合成。rRNA、tRNA和一些其他类型的RNA均由DNA转录生成。 遗传学将DNA分子中最

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