黄鳝载脂蛋白apoAI基因的克隆及序列分析.docVIP

黄鳝载脂蛋白apoAI基因的克隆及序列分析.doc

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黄鳝载脂蛋白apoAI基因的克隆及序列分析

黄鳝载脂蛋白apoAI基因的克隆及序列分析   摘要:以黄鳝肝脏为研究材料,提取总RNA,利用同源克隆技术获得了黄鳝的载脂蛋白apoAI基因的部分编码区和3′UTR,其cDNA序列长度为1 145 bp,其中编码区长度为772 bp,编码256个氨基酸。序列同源性分析表明,黄鳝的apoAI基因的氨基酸序列与其他鱼类的apoAI基因的氨基酸序列具有非常高的同源性,是载脂蛋白家族的一个新成员。黄鳝apoAI基因的克隆为进一步深入研究该基因的功能积累了基础资料,在黄鳝育种及医药研制方面具有潜在的应用价值。   关键词:黄鳝;载脂蛋白;apoAI;克隆;序列分析   中图分类号:Q785;Q959.482文献标识码:A文章编号:0439-811421-4500-03      Molecular Cloning and Sequence Analysis of An apoAI Gene in Rice Field Eel   Monopterus albus      QIU Qing-chong,GENG Xiao-xue,LIU Cheng-du,SUN Wen-xiu         Abstract: Part of coding and 3′ UTR sequences of apoAI gene was cloned from the total liver RNA of rice field eel . Sequence analysis showed that the length of this cDNA sequences was 1 145 bp, including 772 bp coding region and encoded 256 amino acids. Homology analysis showed that there was high sequences similarity between the Monopterus albus and other fishes apoAI genes, which were belong to the apolipoprotein family. Cloning of the Monopterus albus apoAI gene gave the basis for further inverstigation its function, and had the potential application in Monopterus albus breeding and medical usage.   Key words: Monopterus albus; apolipoprotein; apoAI; cloning; sequence analysis      黄鳝广泛分布于亚洲东南部,是一种普遍的淡水食用鱼,具有很高的营养价值和经济价值,现已成为长江流域主要省分水产养殖业的主导产业之一[1]。黄鳝的饲料代谢对黄鳝的科学养殖具有重要意义,一直是生产实践和科研工作的难点和热点之一[2-4]。许多学者研究了饲料中的蛋白质和脂肪含量对黄鳝生长的影响,但由于受黄鳝规格、饲料中的脂肪来源以及实验水温等因素的影响,其结果存在较大差异[2,4,5]。有研究[6]指出,饲料中的能量和蛋白质含量与动物机体的脂类代谢密切相关。因此,寻找与脂类代谢相关的生理指标对于确立饲料中蛋白质和脂肪对黄鳝生长的影响具有重要的意义。载脂蛋白是携带脂肪的主要载体,是构成血浆脂蛋白的蛋白质组分,其基本功能是运载脂类物质及稳定脂蛋白的结构,某些载脂蛋白还具有激活脂蛋白代谢酶、识别受体等功能[7]。在各种载脂蛋白中,载脂蛋白AI是一种主要的载脂蛋白,其可能是参与脂蛋白代谢和维持正常血清脂类代谢平衡的核心载脂蛋白[8]。目前,与黄鳝脂类代谢相关的载脂蛋白基因及其功能的研究鲜见报道。本研究以黄鳝肝脏为研究材料,通过同源克隆获得了其载脂蛋白apoAI基因的序列,并对其cDNA序列进行了分析,以期为深入研究黄鳝载脂蛋白apoAI基因的功能提供基础资料。   1材料与方法   1.1实验材料   实验用黄鳝购自荆州市西门菜市场,质量约100 g,解剖后取其肝脏并迅速放入液氮中冷冻,然后转入-80 超低温冰箱中保存备用。提取RNA所用的Trizol和AMV Rervse Transcriptas购自Invitrogen公司;pMD18-T载体、rTaq DNA聚合酶、DNA Marker DL2000等购自TaKaRa公司;DNA凝胶回收试剂盒购自Omega公司;X-gal、IPTG、琼脂糖、酵母提取物、胰蛋白胨等购自Promega公司;Escherichia c

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