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第13章 生物能学
第13 章 生物能学 ;生物能学是定量研究生物体内能的转换、利用以及作为这些转换、利用基础的化学过程的性质和作用的一门科学。;一、有关热力学的一些基本概念
(一)体系的概念、性质和状态 ;(二)能的两种形式: 热与功
热与功是一个体系在状态发生改变时与环境交换能量的两种形式:热是由温差而产生的能量传递方式,伴随质点无序运动;而功是伴随质点的有序运动。;(四)热力学第一定律:即能量守恒定律
ΔE = Q – W
ΔE为内能的变化,Q代表体系变化时吸收的能量,W代表体系所做的功。; 在恒温、恒压下进行的化学反应,其产生有用功的能力可以用反应前后自由能的变化来衡量。
自由能的变化:
△G = G 产物 — G反应物 =ΔH – TΔS
△G、△H 、△S分别代表体系的自由能变化,焓变化,熵变化; T代表体系的绝对温度。;自由能(G)的概念;△G0,反应能自发进行,能做有用功。
△G0,反应不能自发进行,必须供给能量。
△G=0,反应处于平衡状态。;一个放热反应(或吸热反应)的总热量的变化(△H),不能作为此反应能否自发进行的判据,只有自由能的变化才是唯一准确的指标。
△G0仅是反应能自发进行的必要条件,意味此反应可自发进行,但不等于此反应已明显进行,反应已明显进行还需有活化能,一般靠酶来降低反应的活化能。
当△G0时,反应体系为吸能反应,此时只有与放能反应相偶联,反应才能进行。 ;(一)化学反应的自由能变化( ΔG )公式
ΔG = ΔH -TΔS
;标准自由能变化:在规定的标准条件下的自由能变化,用△G°表示。
标准条件:气压则是1大气压, 25℃;参加反应的物质的浓度都是1mol∕L (意味着 pH=0.0 )。
若同时定义pH =7.0,则标准自由能变化用△G°′表示。
对于一个溶液中的化学反应:
aA + bB → cC + dD ;当反应达到平衡时:△G = 0 ; 从△Go′= -RTln K/eq ,可以求出K/eq及△Go′,根据△Go′与K/eq可以判断任何条件下反应进行的方向及程度。;在25℃条件下,平衡常数K/eq 与标准自由能变化△Go′的关系;在偶联的几个化学反应中,自由能的总变化等于每一步反应自由能变化的总和。
例如:Glc+ATP→G—6—P+ADP(总反应)
第一步,Glc+Pi→G—6—P+H2O ,ΔG0 = +21kJ/mol
此反应不能自发进行
第二步,ATP+H2O→ADP+Pi, ΔG0 = -34kJ/mol
总反应:Glc+ATP→G—6—P+ADP. ΔG0 = -13kJ/mol
因此,一个热力学上不能进行的反应,可与其它反应偶联,驱动整个反应进行。此类反应在生物体内是很普遍的。 ;16; 只有ΔG0的反应才能自发进行。但要注意:
(1) ΔG0的反应可以和ΔG0的反应偶联,使反应能够实际发生。
(2) 有些ΔG00的反应,在非标准状态下,ΔG有可能0。
(3) 热力学第二定律只能确定反应的方向和限度,不能预示反应过程的速率,许多ΔG0的反应,需要提供活化能或使用催化剂才能使反应实际发生。; (1)水作为反应物或产物时,水的浓度通常规定为1(实际浓度约为55.5mol/L)。
(2)生物体系的pH规定为7.0,称作生物体系的标准自由能变化,用ΔG0′表示。如果反应体系的pH不等于7.0,就不能使用ΔG0′ 。
(3)标准自由能的单位用 kJ/mol 表示。;(六)ΔG0′、ΔG以及平衡常数计算的举例;P308举例说明如何用K′求出△Go′ 和△G.
从例子可以看出△Go′ 和△G实际上是两个不同条件下的自由能变化值。
△Go′是标准条件下的自由能变化,即反应物A、B、C、D的起始浓度都为1mol/L,温度为25℃,pH=7.0时的△G。
△G是任意给定条件下的自由能变化,它是反应物A、B、C、D的起始浓度、温度、pH的状态函数,在一个自发进行的化学反应中,自由能总是在降低,△G总是负值,随着反应向平衡点的趋近,△G的绝对值逐渐缩小,直到为0。;三、高能磷酸化合物; ATP水解为 ADP释放静电排斥力; ATP和水转化为ADP,无机磷酸和质子使熵增加。;细胞内影响ATP自由能释放的因素
ATP和ADP均有多种解离形式,并且可以同金属离子相互作用,这些均可影响自由能的释放。;ATP水解释放自由能与pH的关系;AT
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