分子生物学三文件教学.ppt

3 生物信息的传递（上）;DNA;3.1.3 转录延伸;;3.1.4 转录终止;2. 强终止子（不依赖蛋白因子）;3.2 转录机器的主要成分;3.2.1 RNA聚合酶;1. 原核生物RNA聚合酶;;;RNA polymerase II 的结构;3.2.2 转录复合物;转录循环理论：;结合顺序：D-A-B-F-E-H;3.3 启动子与转录起始;3.3.1 启动子区的基本结构;R:嘌呤 Y:嘧啶;E. coli promoters;原核启动子的共有序列和共有间距;3.3.2 启动子区的识别;;;3.3.3 RNA聚合酶与启动子区的结合;RNA polymerase passes through several steps prior to elongation;扩展：;3.3.4 -10区与-35区的最佳距离;3.3.5 增强子(enhancer)及其功能;绝缘子（insulator）是真核生物基因组的调控元件之一，亦为一种边界元件。功能为阻止临近调控元件，对它所界定基因的启动子其增强或者阻遏的作用。它对增强子的抑制作用具有极性，即只对处于其所在边界另一侧的增强子有抑制作用，而并不能抑制与其处于同一结构域的增强子。;3.3.6 真核生物启动子对转录的影响;转录调控因子;3.3.7 转录的抑制;3.4 原核与真核生物mRNA的特征比较;3.4.1 原核生物mRNA的特征;2 许多原核生物mRNA可能以多顺反子的形式存在;50SrRNA;噬菌体：;3 原核生物mRNA的5‘端无帽子结构，3’端没有或只有较短的polyA结构;;例子;原核生物mRNA很少经过加工，但在少数情况下多顺反子mRNA被核酸内切酶剪切成小片段，再作为翻译的模板。;3.4.2 真核生物mRNA的特征;1 真核生物mRNA的5‘端存在“帽子”结构;;0类帽子（cap0） 1类帽子（cap1） 2类帽子（cap2）占有帽mRNA总量10-15%以下。;帽子结构可使mRNA免遭核酸酶的破坏，而且有帽子结构的mRNA更容易被蛋白质合成的起始因子所识别，从而促进蛋白质的合成（实验发现mRNA5’端甲基化帽子是翻译所必需的，且有可能是蛋白质合成起始信号的一部分）。 The 5 cap has 4 main functions:Regulation of nuclear export.Prevention of degradation by exonucleases.Promotion of translation (see ribosome and translation).Promotion of 5 proximal intron excision. ——/wiki/5_cap ;2 绝大多数真核生物mRNA具有多聚A尾巴;AAUAAA;3.5 终止与抗终止;3.5.1 不依赖于ρ因子的终止;内在终止子的特点： 1. 终止位点上游一般存在一段富含GC碱基的二重对称区??其转录生成的mRNA容易互补形成的发卡式结构。 2. 终止位点上游一般有4～8个A组成的序列，转录生成的mRNA的3′末端中相应的有一连串U序列。;3.5.2 依赖于ρ因子的终止;“穷追(hot pursuit)”模型;;3.5.3 抗终止;1 破坏终止位点RNA的茎-环结构;终止构型;2 依赖于蛋白质因子的转录抗终止;3.6 内含子的剪接、编辑、再编码和化学修饰;3.6.1 RNA中的内含子;;内含子两端边界存在共有序列：（GU-AG法则）;;;3.6.2 mRNA的剪接;;U2 U5 U6作用的细节;;;在高等真核生物中，内含子通常是有序或组成性地从mRNA前体中被剪接。 然而……变位剪接：;不同形式的剪接;RNA剪接的调控;与mRNA前体中主要（GU-AG类）和次要（AU-AC类）内含子剪接方式不同，I、II类内含子能进行自我剪接。;;;;;3.6.3 RNA的编辑、再编码及化学修饰;位点特异性脱氨基作用 载脂蛋白C→U导致提前终止 由脱氨基酶催化;RNA的编辑不是很普遍。;尿苷酸的缺失和添加（利什曼原虫属细胞色素B mRNA中发现的）;RNA的编辑的生物学意义： 校正作用 有些基因在突变过程中丢失的遗传信息可能通过RNA编辑修复。 调控翻译 通过编辑可以构建和去除起始或终止密码子，是基因表达调控的一种方式。 扩充遗传信息 能使基因产物获得新的结构和功能，有利于生物进化。;2 RNA的再编码(RNA recoding);HIV-1 genome (shows frameshift);Another example where a recoding event (?1 translational frameshifting) sets up a fixed ratio bet