[化学]第三章 核 酸.ppt

第三章 核 酸 3.1 核酸是生命遗传的化学本质 3.2 核酸的结构 3.2.1 结构单元 3.2.2 多聚核苷酸 核苷酸的5’一磷酸基与另一分子核苷酸的C3’一OH形成磷酸二酯键相连成链状聚合物。 两个核苷酸之间形成的磷酸二酯键通常称为5’-3’磷酸二酯键。C5’端带有一个自由磷酸基，称为5’一磷酸端(常用5’一P表示)；另一端Ｃ3’带有自由的羟基，称为3’一羟基端(常用3’一OH表示)。 多聚核苷酸链具有方向性，当表示一个多聚核苷酸链时，必须注明它的方向是5’一3’或是3’一5’。 3.2.3 DNA的结构 1953年，J．Watson和F．Crick在前人研究工作的 基础上，根据DNA结晶的x衍射图谱和分子模型， 提出了著名的DNA 双螺 旋结构模型. DNA的三螺旋结构 1957年，Rich A用两条poly U和一条Poly A合成一种三链物质，提出了DNA的三螺旋结构。 DNA三螺旋结构与双螺旋结构相似，都是通过分子间氢键形成的： 组成DNA的单链一般是由单一的嘌呤碱和单一的嘧啶碱组成； 组成三螺旋有两种情况：嘧啶-嘌呤-嘧啶、嘌呤-嘌呤-嘧啶； 每条单链至少又8个核苷酸构成。 3.2.4 RNA的结构和分类 1. RNA的结构 组成：4种核苷酸，AUCG； 连接：同DNA 形成：一般以DNA为模板合成， 有例外。 结构：单链线形分子，嘌呤碱 ≠嘧啶碱； 局部区域有双螺旋结构， 配对不严格，G和C 也可以G和U配对； 不能形成双螺旋的部分 形成突环 3.3 嘌呤碱基和嘧啶碱基的性质和化学反应 嘌呤碱基和嘧啶碱基的性质和反应性能对核酸的性质和生理功能有重要影响。 嘌呤碱基和嘧啶碱基具有弱碱性，在水中溶解度很小，转变成核苷酸后，溶解度大大增加。 嘌呤碱基和嘧啶碱基都为高熔点的无色晶体。 3.3.1 碱基的芳性和结构互变 x衍射分析证明，嘌呤环和嘧啶环均呈平面或接近 于平面的结构。碱基的芳香环与环外基团可以发生 酮式一烯醇式或胺式一亚胺式互变异构。 3.3.2 碱基的碱性 嘌呤碱和嘧啶碱都具有弱碱性。杂环上碱基的PKa 值约为9.5，环外的胺基碱性很弱，在生理条件下 不能质子化。 亲电进攻： 嘧啶环中C5位最为活泼，而嘌呤环中，C8位最活泼 尿嘧啶核苷与羟胺在pH=9～10条件下反应，将发生碱基开环分解反应。 3.4.2 核酸的水解 酸或碱水解 酸或碱可水解多聚核苷酸，例如0.1M NaOH即可将 RNA完全水解,而相同条件下DNA不受影响，说明DNA 的碱水解比RNA困难得多。这种水解性能上的差别， 与RNA核糖基上2｀-OH的邻基参与作用有很大的关 系。 DNA和RNA水解稳定性上的明显差异具有重要的生物 学意义。 3.5 核酸碱基顺序分析中的化学反应 3.5.1 Maxam-Gilbert法 1975年， Maxam 和 Gilbert利用有机化学方法， 选择性地切断某种特定的核苷酸所形成的磷酸二酯 键，得到不同长度的小片段。此法又称为化学降解 法。 包括：碱基选择性水解 DNA小片段的电泳分析和碱基顺序推测 Maxam-Gilbert法: 用放射性同位素32P标记末端的DNA片段，在5组互相独立的化学反应中分别得到部分降解，每一组反应特异地针对某一种或某一类碱基，因而产生了5组放射性标记的分子，从共同起点（放射性标记末端）延续到发生化学降解的位点。每组混合物中均含有长短不一的DNA分子，该组反应所针对的碱基在原DNA全片段上的位置决定了DNA 分子的长度。然后，通过对各组进行聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，放射自显影检测末端标记分子。 3.5.2 Sanger法： 3.6 核苷酸的衍生物 3.6.1 ATP和GTP ATP：三磷酸腺苷 ATP是重要的能量 来源和磷酰化剂 ATP的化学合成： 3.7 多聚核苷酸的生物合成 3.7.1 DNA的生物合成 DNA的生物合成即DNA的复制， Watson和Crick开 创性的论文，对DNA双螺旋的描述以这样一段陈述 结尾：“不出我们的意料，我们所假设的特异性配对 立即提示一种遗传物质可能的复制机制。” 复制时, 每一条DNA链在新链合成中充当模板，按 碱基配对方式形成两个新的DNA分子，每个分子都 含有一条新链和一条旧链，这种复制方式即半保留 复制(semiconservative replication)。 3.7.2 RNA的生物合成 DNA携带的遗传信息（基因）传递给RNA分子的过程称转录（transcription ）。 在生物界，RNA合成有两种方式：一是DNA指导的RNA合成，此为生物体内的