【计算机】CHAPTER 1 从药学计算科学谈起.pptVIP

计算机在药学中的应用 于净 沈阳药科大学计算机教研室 电话办公) 手机) Email:yujing_wgy@ QQ:664102042 1 从药学计算科学谈起…… 1.1 什么是药学计算科学（1） 在我国药学一级学科中，其主干学科包括药剂学、药理学、药物分析、药物化学、药物设计、中药学等学科和化学制药及生物技术制药等工程学科。 每一个学科的科学研究和生产过程都产生大量的数据信息，对这些信息进行处理称为药学计算，而描述和变换这些信息的算法过程，包括其理论、分析、设计、实现和应用的系统研究统称为药学计算科学。 1.1 什么是药学计算科学（2） 它的基本问题是，什么能（有效地）自动进行，什么不能（有效地）自动进行。 本学科来源于药学、依赖于数理逻辑、计算模型、算法理论和自动计算机器的研究。 计算的渊源可以扩展到数学和工程。数学为计算提供了理论和方法，而工程为实际计算和应用提供了可以能自动运行的设备，并为有效地完成计算和应用任务提供了工程方法和技术。形成了计算科学。 1.1 什么是药学计算科学（3） 怎样判断一类计算问题是否机械可解？这其中就涉及到计算模型，以使判断机械可解的判定问题及其结果有一个共同的、合理的基础，以便确定可计算与不可计算的边界。图灵的计算模型与计算机最为接近 长期以来，在数学研究中，由于分析技术比较发达，人们常常倾向于和习惯于采用演算的思想而忽视了算法的思想。图灵所以取得成功，很重要的一条是它采用了算法的思想研究计算的过程，并由此揭示可计算的概念。有了算法才有程序 1.2 计算科学发展的主线（1） 第一层面是计算科学的应用层 第二层面是计算科学的专业基础层 第三层面是计算科学的基础层 需要指出的是，不同学者，由于知识背景不同，对计算学科发展主线的认识也不同。这里，仅仅是作者提出的一种参考意见。 了解这些对于开发药学计算应用将有很大好处，至少不会割断历史。 1.2 计算科学发展的主线（2） 1.2.1 计算模型与计算机系统 手指、结绳、算筹 、算盘 齿轮 、手摇计算机 帕斯卡(B. Pascal) 、莱布尼兹(G. W. Leibniz) 巴贝奇(C. Babbage) 、布什(V. Bush) 布尔(G. Bool) 、图灵 洪加威 、冯·诺伊曼 可见，在这一主线上，发展新型计算模型和计算理论，为新一代计算机的设计提供新思想是多么重要，其重要性绝不亚于发明具体计算机的研制技术。 1.2 计算科学发展的主线（3） 1.2.2 计算模型与计算机软件 1954, Fortran 1960, Algol 60 1959, COBOL 1964, BASIC 编译原理与技术 语法和语义处理 操作系统、数据库系统、人工智能、软件开发方法学 、计算语言学 计算机网络、分布式处理和多媒体 1.2 计算科学发展的主线(4) 1.2.3 计算模型与计算机应用 科学计算 计算机图形学 计算机辅助设计(CAD)、计算机辅助教学(CAI) 数据库技术、信息管理系统 、决策系统 人工智能 1.2 计算科学发展的主线（5） 综上所述，计算机应用主线各方向上的研究工作，都与计算模型有着密切的关系。 理论上，凡是可以用计算机来处理的问题及其处理过程，都可以用计算模型来描述；凡是可以用离散数学为代表的构造性数学描述的问题及其处理过程，只要所涉及的论域是有穷的，或虽为无穷但存在有穷表示，也一定可以用计算机来实现。 1.2 计算科学发展的主线（6） 我们已经知道了在计算科学中，计算比实现计算的技术更重要。 正是计算科学的这一学科属性，决定了技术在整个学科中与理论相比只占有相对次要的地位，决定了计算科学主要不是以经验科学占主要成分的学科，而是一门以数学为主要基础的学科，它是一门科学，或技术科学。 1.3 计算科学的分类与分支 1.3.1 构造性数学基础 数理逻辑、代数系统、图论、集合论等 1.3.2 计算的数学理论 计算理论、高等逻辑、形式语言与自动机、形式语义学等 1.3.3 计算机组成原理 计算机原理与设计、体系结构、微机接口等 1.3.4 计算机软件基础 算法、数据结构、高级语言、程序设计、编译语言、数据库、操作系统、软件工程等 1.3.5 计算机应用技术 数值计算、图形学与图像处理、网络、多媒体、计算可视化与虚拟现实、人工智能等 1.4 药学计算基本原理和常用方法(1) 第一种形态是理论，基于计算科学的数学基础和计算科学理论，广泛采用数学的研究方法。 按统一的合理的理论发展过程，包含以下四个步骤： （1）对研究对象的概念抽象（定义）； （2）假设对象的基本性质和对象