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- 2018-03-07 发布于天津
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考虑到PPIN的复杂性,研究人员往往从多种方向和视角来研究某一生物所有的蛋白质相互作用。 而在研究PPIN的计算方法中面临着许多挑战性问题。 运用生物信息学的方法由繁入简。研究的广度 实验分析的方法由简入繁。研究的深度 研究蛋白质相互作用的表象与其生物学意义的关系和其中的规律 蛋白质相互作用是一种表象,通过表象分析规律,是研究蛋白质相互作用的核心 从“种瓜得瓜,种豆得豆”到孟德尔遗传定律 现象 科学问题 研究方法和技术 酵母蛋白质相互作用联络图 人蛋白质相互作用联络图 如此复杂的相互作用,哪些是有相关功能的?哪些是“噪音”? 整体 系统 部分 单体 在研究PPIN的计算方法中面临着许多挑战性问题。 a:为全面了解某一生物功能的机理,研究并确定PPIN中两个节点之间相互作用的边是需要解决的第一个重要问题,这被称为小规模实验。 b:研究PPIN的拓扑结构和规模,对于了解该网络的全局性能是非常重要的。 c:研究PPIN中蛋白质复合体是至关重要的。一些蛋白质可与其他多个蛋白质结合组成蛋白质复合体。通常这些复合体可以组成一个稳定的单位,在一定时间内不会发生重大变化。但也有另一些高度动态变化的复合体可导致细胞状态和功能的改变。 c:蛋白质复合体的形态可转化为其他不同形态,由此可以构造一种蛋白质复合体形态演化网络。 d:生物体内
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