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DNA合成总结
DNA的生物合成总结
一、 DNA复制的特点
1、DNA的半保留复制
半保留复制(semiconservative replication):DNA复制时,每一条DNA链在新链合成中充当模板,按碱基配对方式形成两个新的DNA分子,每个分子都含有一条新链和一条旧链。
生物学意义: DNA的半保留复制表明了DNA在代谢上的稳定性,保证亲代的遗传信息稳定地传递给后代。
2、有特定的复制起点和方向
复制是一个高度协调的过程,母链解链和复制同时进行。
起点(origin,ori):复制起始部位的一段核酸序列,控制复制的起始。
终点(terminus):终止DNA复制的一段核酸序列。
复制子(replicon):基因组中能独立进行复制的单位(复制起点到终点的核酸片段)。原核生物只有一个复制子;真核生物含多个复制子,多个起点和终点,形成多个 “复制眼”或“复制泡”。
复制方向:大多为双向对称复制,也有单向(不对称)复制;新生DNA链的合成方向为:5’→3’。
3、半不连续复制
DNA的半不连续复制(semidiscontinuous replication): 前导链的连续复制和后随链的不连续复制方式。
冈崎片段(Okazaki fragment): 1968年冈崎发现,在不连续的后随链DNA合成中形成的DNA短片段;在原核生物有1000~2000核苷酸,真核生物约100~200核苷酸。
4、需要引物
引物(primer):和模板链互补的线性核酸小片段,其上带有能与核苷酸相结合的游离3′-OH,通常是寡聚RNA。
二、DNA复制的条件
1、底物
四种脱氧核糖核苷酸,即dATP,dGTP,dCTP和dTTP。
2、模板
模板(template): DNA复制时解开的两股亲代DNA链;DNA复制是模板依赖性的。
3、引发体和RNA引物
4、DNA聚合酶
1) DNA聚合酶(DNA polymerase,DNA-pol):催化依赖于DNA模板的由脱氧核苷三磷酸前体合成DNA的酶。
2) DNA聚合酶的作用特点
4种dNTP底物(dATP、 dGTP、dCTP和dTTP);
接受模板指导;
需引物提供3′-OH;
新链生长方向: 5′→3′;
产物DNA的性质与模板相同;
DNA复制过程中还需其它酶和蛋白质因子。
5、DNA连接酶
DNA连接酶(ligase):催化两段DNA片段之间磷形成酸二酯键,而使两段DNA连接起来,不能将两条游离的DNA单链连接起来。
6、单链DNA结合蛋白
单链DNA结合蛋白(single strand binding protein,SSB):一些能够与单链DNA结合的蛋白质因子。
作用:维持单链状态,防止复性;对抗核酸酶水解,保护单链完整。
7、解旋酶
解旋酶(unwinding enzyme):又称解链酶(helicase),是用于解开DNA双链的酶蛋白,每解开一对碱基需消耗两分子ATP。
8、拓扑异构酶
拓扑异构酶(topoisomerase)Ⅰ:可使DNA双链中的一条链切断,松开双螺旋后再将DNA链连接起来,其作用是松解负超螺旋,同转录有关。反应无需供给能量。
拓扑异构酶Ⅱ:切断DNA双链,使DNA的超螺旋松解后,再将其连接起来。
三、原核生物DNA复制的过程
1、预引发
解旋解链,形成解旋复合物:DnaA蛋白识别复制起始点形成起始复合物,在其他蛋白、拓扑异构酶和解旋酶作用,使DNA的超螺旋及双螺旋结构解开,碱基间氢键断裂,形成两条单链DNA。形成叉状结构。
引发体组装:SSB结合在两条单链DNA上,与其他蛋白因子及引物酶一起组装引发复合物。
引发:在引物酶的催化下,以DNA为模板,合成一段短的RNA片段,获得3端自由羟基(3-OH)。
2、复制的延伸
由DNA聚合酶Ⅲ催化,以3’→5’方向的亲代DNA链为模板,从5’→3’方向聚合子代DNA链。
引发体移动:引发体向前移动,解开新的局部双螺旋,形成新的复制叉,后随链重新合成RNA引物,继续进行链的延长。
前导链的延长: DNA pol Ⅲ全酶二聚体的一个亚基与前导链的模板结合而发挥催化作用,与复制叉前进的方向同向。
后随链的延长:DNA pol Ⅲ全酶二聚体的另一半与后随链的模板结合发挥催化作用。
后随链合成片段也沿5′→3′方向延长,模板成环状才能与酶催化时向前移动的方向一致。
后随链片段合成接近上一后随链片段的5′末端时,模板被释放,环消失。继续重复,连续进行。
3、复制的终止
细菌环状染色体的两个复制叉向前推移,在终止区相遇而停止复制,复制体解体。
4、DNA复制的保真性
为了保证遗传的稳定,DNA的复制必须具有高保真性。
维持DNA复制准确性的因素:
1) 外因:四种dNTP要平衡;Mn2+和Mg2+的比例、浓度(酶活)。
2) 内因:
按碱基配对原
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