医学生物信息基础_第6讲_重要的生物信息学中心教材教学课件.ppt

第七章 ;第一节 重要生物信息中心 简 介;生物信息中心是生物信息学一切工作出发点。 大量生物信息集中在一些国际或家的生物信息中心。这些中心除具有硬件、人员、研究体系外，还提供数据库检索服务，检索工具和各种免费软件。 本章首先介绍一批重要的国际、国内的生物信息中心和网点。 ;生物信息中心对BI的开发和应用;一、国际著名生物信息中心Bioinformatics Centres;?数据每天交换序列数据和注解相同;国内部分生物信息学和生物医学信息中心服务器 北京大学生物信息中心 中国生物信息 / 北京大学物理化学研究所 北京医科大学生物医学信息 中国科学院微生物研究所 天津大学生物信息中心 中科院计算所智能信息处理重点实验室生物信息学研究组 / 中国科学院基因组信息学中心 / ; （一）NCBI美国国家生物技术信息中心 ( National Center for Biotechnology Information, NCBI )。 网址：/; NCBI 研究开发 数据库 数据提交 数据库 PubMed 结 构 分类数据库 查询相似 查找 序 列 结构 Bankit BLAST MEDLINE 结构 GenBank MMDB Entrez 分析 进化树 工具 序列 结构 MMDB 分析 改进数据库 计算机分析 工具 图. 美国国家生物技术信息中心(NCBI)结构图;NCBI;NCBI -Entrez检索平台;; 1. PubMed PubMed 是国家医学图书馆(NLM)的搜索服务器。与网上杂志及相关数据库的链接，可以使用户方便快捷地检索到有关信息，而且目前可以通过相关链接得到许多种杂志的全文。; 2. BLAST 局部排列基本搜索工具 ( Basic Local Alignment Search T001) 是一套相似性搜寻程序，可识别特定序列的分类和可能的同源性。 这些程序的功能强大，能分析DNA和蛋白序列。其详细情况将在有关的章节里给予介绍。;; 3. Entrez NCBI开发了Entrez 数据库查询系统，用于对GenBank 等分子生物学数据库以及生物医学文献摘要(Medline)等数据库的查询。 Entrez 采取自动列出相关记录的方法，实现同一数据库中不同条目或不同数据库之间的链接。当用户以关键词查找某个条目时，可以从查询结果所列出的条目中找到与其相关的其他条目，包括文献摘要、基因组和染色体图谱、核酸和蛋白质序列数据库、蛋白质结构数据库等，使用十分方便。 与SRS不同，Entrez 是一个封闭的