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送样要求 动植物基因组从头测序 三、送样要求 1、DNA样品：基于Illumina平台，PE文库DNA浓度≥20 ng/μl，总量≥6μg（荧光定量），MP文库DNA浓度≥40ng/μl，总量≥12μg（荧光定量）；基于Roche 454 FLX+ 平台，DNA浓度≥20ng/μl，总量≥3μg（荧光定量），电泳检测无明显RNA条带，基因组条带清晰、完整，主带应在100 kb以上。若样品中有多糖、糖蛋白的残留， 对打断DNA样品带来非常大的困难，且很难去除，因此特别要求所提供的样品不要有多糖或糖蛋白污染。 ? 2、动物样品：样品最好来自纯系，对于一般物种应挑选肝脏、肾脏、血液等组织取样，对于珍贵物种请提供耳样、毛发（带毛根）等脂肪含量较少的组织进行取样。为了减少个体差异对后续拼接产生的影响，尽量从同一个个体中取样。若物种体积较小，从一个个体中提取的DNA量不能满足测序实验所需，在保证量的前提下，应尽量减少采样个体的数量。提供组织样品应500mg，尽量提供较多量，不用的物种DNA提取产物有差异。 ? 3、植物样品：样品最好来自纯合体或单倍体。需为黑暗无菌条件下培养的黄化苗或组织样品。提供组织样品应500mg，尽量提供较多量，不同的物种DNA提取产量有差异 动植物基因组重测序 三、送样要求 1、DNA样品：Miseq DNA PE 文库浓度≥20 ng/μl，总量≥6μg（荧光定量）；Miseq DNA?MP文库浓度≥40ng/μl，总量≥12μg（荧光定量）；454 DNA库浓度≥20ng/μl，总量≥3μg（荧光定量），电泳检测无明显RNA条带，基因组条带清晰、完整，主带应在100 kb以上。若样品中有多糖、糖蛋白的残留， 对打断DNA样品带来非常大的困难，且很难去除，因此特别要求所提供的样品不要有多糖或糖蛋白污染。?? 2、动物样品：对于一般物种应挑选肝脏、肾脏、血液等组织取样，对于珍贵物种请提供耳样、毛发（带毛根）等脂肪含量较少的组织进行取样。为了减少个体差异对后续拼接产生的影响，尽量从同一个个体中取样。若物种体积较小，从一个个体中提取的DNA量不能满足测序实验所需，在保证量的前提下，应尽量减少采样个体的数量。??提供组织样品应500mg，尽量提供较多量，不用的物种DNA提取产物有差异。 ? 3、植物样品：? 植物材料应尽量选取植物组织幼嫩部位。提供组织样品应500mg，尽量提供较多量，不用的物种DNA提取产物有差异。 微生物基因组从头测序三、送样 要求 1、细菌：浓度≥200 ng/μl，总量≥50 μg；OD260/280值介于1.8-2.0之间的细菌基因组DNA，并确保电泳检测无明显RNA条带，基因组条带清晰、完整，主带应在100 kb以上，DNA无降解，无污染。??? 2、真菌：样品浓度≥200 ng/μl，总量≥50 μg，OD值介于1.8-2.0之间的DNA，样品浓度越高越好。真菌的De novo 测序获得精细图，若基因组大小介于10~45Mb之间，需提供至少100μg的DNA，若基因组大小大于45Mb，则需200 μg的DNA。?? 3、样品保存期间切忌反复冻融。? 4、送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm 膜密封。? 5、提供DNA电泳检测照片，用自封袋密封后随样品一起送样。 微生物基因组重测序 1、 细菌：浓度≥200 ng/μl，总量≥50 μg ，OD260/280值介于1.8-2.0之间的细菌基因组DNA，并确保DNA无降解，无污染。 2、 真菌：样品浓度≥200 ng/μl，总量≥50 μg ，OD260/280值介于1.8-2.0之间的DNA，样品浓度越高越好。? 3、 样品保存期间切忌反复冻融。? 4、 送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm 膜密封。? 5、 提供DNA电泳检测照片，用自封袋密封后随样品一起送样。 有参考基因组的转录组测序 ? 1. 总RNA：针对Ion proton测序平台，浓度≥100 ng/ul，要求总量≥1 μg；针对Illumina测序平台，浓度≥80 ng/ul，总量≥12 μg；OD260/280介于1.8-2.2之间，OD260/230值应≥2.0。电泳检测28S:18S至少大于1.5；并确保RNA无降解，无污染；或提供浓度≥50 ng/μl，总量≥500 ng的mRNA，同时，提供质量检测相关数据和图片，包括分光光度计、电泳胶图或Nanodrop仪器检测数据，不建议提供mRNA，较难定量。 2. 组织样品：动物、植物、微生物总量大于500 mg的新鲜样品(植物材料应尽量选取幼嫩部位)。采样后将样品立即用RNAlater和液氮速冻，保存于-80℃(保存期不超过一个月)，送样时使用干冰运输(不超过72 h)；提取RNA后经变性电泳，保证各