临床信息学中的本体.ppt

最优化是实践：标准化医护 一些著名的临床本体 临床医学：GALEN 人类解剖学：数字解剖学家本体 家庭医学：家庭实践本体美国部分 基于指南的医护：GLIF 少部分ICD9-CM 724 Unspecified disorders of the back 724.0 Spinal stenosis, other than cervical 724.00 Spinal stenosis, unspecified region 724.01 Spinal stenosis, thoracic region 724.02 Spinal stenosis, lumbar region 724.09 Spinal stenosis, other 724.1 Pain in thoracic spine 724.2 Lumbago 724.3 Sciatica 少部分ICD9-CM 724.4 Thoracic or lumbosacral neuritis 724.5 Backache, unspecified 724.6 Disorders of sacrum 724.7 Disorders of coccyx 724.70 Unspecified disorder of coccyx 724.71 Hypermobility of coccyx 724.71 Coccygodynia 724.8 Other symptoms referable to back 724.9 Other unspecified back disorders 术语的分类手册 大部分医学分类体系实际上是thesauri Thesauri有混合性层次结构 如– Kind-of, part-of, caused-by, modified-by, ... 例如heart（心脏） heart valve（心瓣膜） aortic valve（主动脉瓣） cusp of aortic valve（主动脉瓣尖部） 术语的分类手册 Thesauri需要人类的理解 只有人类可以组织其结构（而且这不是简易而快速的工作） 应用的模型是隐含的和固定 本体在提供术语自动分类中的应用 通过严格的层次的明确关系 ‘Disorder of heart’（心脏病） ‘Disorder of valve in heart’（ 心脏瓣膜病） ‘Disorder of valve in left ventricle in heart’（左心室瓣膜病） ‘Disorder of cusp in valve in left ventricle in heart’ （左心室瓣膜尖部疾病） 本体在提供术语自动分类中的应用 允许计算机推导关系 人类能理解（但并非必须） 计算机可以重组织，因为在形式表达中，所有的意义是清晰的 GALEN项目（欧盟） 为医学概念模型 获取应用医学术语深层的一般原理和知识 从独立于语言的表述产生多语言表达 GALEN表述和整合语言（GRAIL） 为用于复合表达的一描述逻辑 为概念操作提供一个规则集合 术语学服务器 为应用程序客户提供编程界面 GRAIL概念模型 提供结点（概念），有向弧（陈述）标有属性 允许用户利用newSub操作子生成元概念 机体部分newSub手 应用ValueType定义lexicons集合 (SymbolicValueType newSub LateralityType) newsub [left right] 用which操作子定义复合概念 (Hand which hasLaterality left) name LeftHand 复合概念的构造可导致晦涩难懂 (Surgical Deed which is mainly Characterised By performance which is Enactment Of (Excising which plays Clinical Role Surgical Role) which acts Specifically On (Lobe which is Specific Solid Division Of Lung))) “Excision of lobe of lung” (“肺叶切除”) GRAIL 描述逻辑指导模型 防止系统生成无意义表述，如 (Hand which hasLaterality up) 提供3层次的认可 1.语法性层次 (BodyPart which hasLaterality lateralityType) 2.合理性层次 (Hand whi