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4.检测样品 目前检测样品是marker0.2μl ,上样量1.0μl,总体积10μl 样品的准备:甲酰胺与marker 混合均匀分装,加入样品后振荡, 离心,95℃变性5min,冰浴3min, 离心,上样。 5.结果的存储 先在“我的电脑”的E盘上建一个文件夹用于储存结果,在数据收集软件中有 可以进行设定。 结果的重新导出: 结果可以重新导出,或将所需要的部分结果重新导出到指定文件夹。 6.手动控制 注意:手动控制oven时要“send”两次,一次设定温度一次打开oven。 四.数据分析软件的简介 应用GeneMapper进行数据的分析,下面进行简单的介绍。 1.Panel及bin的导入 2.分析数据 添加要分析的文件夹: panel Size standard Analysis method 分析后如果如下图所示:不通过,查找原因。 查看原始数据: 查看内标: 结果所得图形: 分析工具栏: → 常见问题的解析 1.所有毛细管没有数据 原因:毛细管或block通路中有气泡 没有样品进入 自动进样器不在正确位置,使毛细管头吸入气泡或接触不到样品 措施:重新正确上样,排气泡,拆毛细管清洗block,syring,更换胶 * ABI3100简介 及 其常见问题解析 姜艳艳 2007.3.9 主要内容 ABI遗传分析仪简介 ABI3100相关简介 ABI 3100构造及毛细管工作原理 数据收集软件的简介 数据分析软件的简介 常见问题解析 一. ABI遗传分析仪系列 ABI测序仪和遗传分析仪系列: 377 DNA 测序仪 所采用的是板胶 最多可同时检测96个样品,要人工手动上样。 采用Genescan和Genotyper进行分析。 310遗传分析仪 采用一道的毛细管进行电泳。 一支注射器注胶 不能使用96孔板,使用48或96孔的模块,0.5ml的离心管上样。 所使用的软件及设置与377比较相像。 3100和 3100Avant基因分析仪 3100为16道毛细管 3100Avant为4道毛细管 使用96孔板或384孔板进行电泳 使用注射器将胶注入毛细管,且有两支注射器 3130 和 3130xl 基因分析仪 3130为四道, 3130xl为16道。 从胶瓶中自动吸胶注入毛细管。 软件方面与3100基本相同。 3730 和 3730xl 基因分析仪 3730为48道毛细管3730XL为96道毛细管的 其他与3130基本相同 型号 毛细管状态 胶的状态 备注 377 无 聚丙稀酰胺凝胶 使用板胶,人工上样 310 1根 POP-6和 POP-4 注射器自动灌胶 3100Avant 4根 POP-6和 POP-4 3100 16根 POP-6和 POP-4 3130 4根 POP-6和 POP-4 自动排气泡,灌胶 3130xl 16根 POP-6和 POP-4 3730 48根 POP-6和 POP-4 3730xl 96根 POP-6和 POP-4 主要性能参数: 此图表示的是:气泡没有排出通道。 注意96孔板的使用。3100是16道的,每个run 使用两排孔。若是4道的则是每个run 4孔,注意与样品名的对应。 310 是单道的毛细管,不能使用96孔板,而是使用0.5ml 的离心管上样。 阳极有电极插在buffer中 阴极没有电极,而是在毛细管外包裹着一层金属,插在buffer中。 与3100不同,310在毛细管旁边有一根金属电极插在buffer中。 2.毛细管工作原理 毛细管两端: 电渗流:pH大于6时,石英带负电荷,熔融的石英毛细管内层带负电,来自毛细管内的溶液的正电荷产生电渗流,沿负电荷的毛细管壁形成双层,在电场作用下,双层中的阳离子向阴极移动,带动可溶分子向同一方向移动。 为保证DNA片段分离的重复性,必须包埋毛细管内壁以除去电渗流,ABI3100采用能进行DNA分离的POP-4或POP-6胶线性包埋毛细管内壁,阻止电渗流,使DNA从阴极到阳极没有液体的流动。毛细管的包埋使之随着时间而性能有所降低,影响使用寿命。 电泳: 检测: 一束激光被分成两束从毛细管的两侧同时照亮16根毛细管,当DNA片段经过检测室时,所带荧光染料被激发,荧光被检测到,形成胶图。 三.数据收集软件的简介 1.开关机器 顺序:电脑,3100机器,收集软件(关机相反) 2.
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