生命科学前沿进展——RNA干扰－魏炽炬.PPTVIP

1. 染色体结构的调控2. 转录水平的调控3. 转录后水平的调控4. 翻译水平的调控5. 翻译后水平的调控 生物体中有一群小RNA（目前看来人体中编码约255种小RNA，竟占整个基因组近1%，很多可能编码自以前被认为的“垃圾DNA”）可以影响蛋白表达水平，从而控制细胞的多种生命活动. 尤其在发育过程中2003年有一些激动人心的最新发现： 仅约22个核苷酸长度的小RNA，发现竟能引导早期发育——从使植物叶片成形到介导果蝇胚胎在植物组织中的细胞增殖； 缺少RNAi蛋白Dicer（一种RNA酶III家族的酶，参与RNAi过程中对RNA的剪切）的小鼠会缺少干细胞的某些分化系（swathsofstemcells），在出生前就夭折； 小鼠中特定的小RNA能帮助引导干细胞生成胚胎的血细胞系统. 1）抗病毒功能 Voinnet和Li等分别在植物和果蝇中发现了通过RNAi实现的抗外源核酸机制：被大多数RNA病毒启动的RNAi可导致病毒基因组降解。 例如在果蝇细胞中，Flock house virus(FHV)就能引发果蝇内部的RNAi反应，产生FHV特异性的siRNA来降解感染的FHV。 2）基因调控 目前在人、蠕虫，果蝇和植物等生物体中都发现了小RNA，有的通过结合3‘非翻译区（UTR）和靶mRNA抑制mRNA翻译，有的作为siRNA通过RNAi机制破坏靶基因转录本。 3）染色质浓缩 内源的一些siRNA可能通过使染色质浓缩调节基因表达。 一些研究小组发现dsRNA结合到植物启动子区域能通过一种使DNA甲基化的作用导致基因沉默； 在蠕虫体内检测到许多Polycomb蛋白（能结合染色质）是RNAi过程所必须的； 裂殖酵母中内源siRNA可介导中心粒区染色质浓缩，导致这个位点的基因转录沉默。如Vera Schramke等在裂殖酵母中通过合成shRNA反式抑制同源位点，导致在mate区沉默的Swi6染色质浓缩。 这些结果都提示一些内源性的siRNA通过导致染色质浓缩来调节基因水平。 4）转座子沉默 目前，两方面的证据提示转座子沉默涉及siRNA。 其一，发现蠕虫mut-7基因参与RNAi和转位抑制。 其二，从裂殖酵母的中心粒区也分离出siRNA，并检测到这些siRNA介导此区内组蛋白甲基化。由于中心粒区包含重复序列——含转座子片段，在一些减数分裂基因中也发现了通过其附近的逆转录转座子LTR（长末端重复序列）介导的RNAi，推测在siRNA介导的中心粒区域的组蛋白甲基化可能源于古老的转座子沉默作用。 5）基因组重组 siRNA可能参与纤毛虫，四膜虫虫体间结合时的基因重组。 结合到重组序列的siRNA，在虫体之间的结合过程中介导DNA缺失和染色体断裂。 有趣的是，在这些siRNA介导的程序性DNA删除事件中，也发现需要重组区域组蛋白的甲基化。 CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) are direct repeats found in the DNA of many bacteria and archaea. These repeats range in size from 24 to 48 base pairs. They usually show some dyad symmetry but are not truly palindromic. The repeats are separated by spacers of similar length. Spacers are usually unique in a genome. Some spacer sequences match sequences in phage genomes; it was proposed, and more recently demonstrated, that these spacers can be derived from phage and subsequently help protect the cell from infection. Consequently, an active CRISPR repeat array may evolve rapidly. Different strains of the same species of bacterium often can be differentiated according to differences in the spacers in their CRISPR arrays, a technique called . Sets of gene