Illumina光纤微珠芯片技术及应用.ppt

基因芯片的基本原理 基因芯片又称DNA微阵列（microarray），把大量已知序列探针集成在一个基片上，然后与标记的样品进行杂交，通过检测杂交信号来检测信息 基因芯片制备 原位合成法， 原位合成法是基于组合化学的合成原理,它通过一组定位模板来决定基片表面上不同化学单体的偶联位点和次序。原位合成法制备DNA芯片的关键是高空间分辨率的模板定位技术和固相合成化学技术的精巧结合。 点样法。 基因芯片点样法首先按常规方法制备cDNA（或寡核苷酸）探针库，然后通过特殊的针头和微喷头, 分别把不同的探针溶液，逐点分配在玻璃、尼龙或者其它固相基底表面上不同位点,并通过物理和化学的结合使探针被固定于芯片的相应位点。 原位合成 点样技术 片断长度不受限制 需要预先准备大量的核苷酸 点的大小，间距较难控制 新一代芯片技术   光纤微珠芯片 1.微珠 Oligator? 合成工厂 Key Technology Elements: Bead Chemistry Key Technology Elements: Bead Production Key Elements: Random Bead Assembly Key Elements: Decoding 每张芯片上每个微珠每个特性都被质控(100%QC) 位置和强度控制 有多少重复 小部分不合格地被捡出 是Illumina 出厂前的生产步骤 每个芯片在出厂前已通过解码和质控 解码 CD 随芯片送至用户处 Key Elements: Decoding Quality Metrics Key Elements: Decoding Quality Metrics BeadArray Formats BeadArray Formats BeadArray Formats BeadArray Formats BeadArray Formats BeadStation?扫描系统 Sentrix Array Matrix Sentrix BeadChip Formats Human-6 HumanRef-8 Universal-16 Custom-16 Human-1 Sentrix Array Matrix Sentrix BeadChip Formats Human-6 HumanRef-8 Universal-16 Custom-16 Human-1 GoldenGateTM Genotyping and DASLTM “Universal Array” Sentrix Array Matrix Sentrix BeadChip Formats Human-6 HumanRef-8 Universal-16 Custom-16 Human-1 Focused GEX Sets(Standard Samplers, Custom BeadPools) Sentrix Array Matrix Sentrix BeadChip Formats Human-6 HumanRef-8 Universal-16 Custom-16 Human-1 Whole Genome Gene Expression Sentrix Array Matrix Sentrix BeadChip Formats Human-6 HumanRef-8 Universal-16 Custom-16 Infinium InfiniumTM Whole Genome Genotyping 激光共聚焦扫描系统 高分辨率, 0.8 micron 双色激光 at 532 635 nm 光纤微珠芯片---技术原理 超高分辨率 全自动化定位,扫描 BeadArray Reader Confocal laser scanning system Sub-micron, 0.8 micron Two lasers 532, 635 nm Supports Cy3 Cy5 imaging Auto-focusing, centering and tilting without photo bleaching Supports genotyping, gene expression applications Scans both Array Matrix and BeadChip microarrays Sentrix Bead Chip: Analytical Fluorescent Image User Supplied Dual-block 96-well thermal cycler w/heated lid