嗜热四膜虫腺苷三磷酸结合盒转运蛋白ABCC10基因的可变剪切分析.PDFVIP

动 物 学 研 究 2011，Dec. 32(6): 605−610 CN 53-1040/Q ISSN 0254-5853 Zoological Research DOI ：10.3724/SP.J.1141.2011.06605 嗜热四膜虫腺苷三磷酸结合盒转运蛋白ABCC10 基因的 可变剪切分析 1,2 1,2 1 1,* 陆星亦 , 熊 杰 , 袁冬霞 , 缪 炜 (1. 中国科学院水生生物研究所 水生生物多样性与保护重点实验室, 湖北 武汉 430072; 2. 中国科学院研究生院, 北京 100049) 摘要：哺乳动物中腺苷三磷酸结合盒转运蛋白(ATP-binding cassette transporter, ABCT)可通过可变剪切产生多 种转录本, 其中含有提前终止密码子(premature terminal codon, PTC)的转录本还可与无义介导的mRNA 降解通路 (nonsense-mediated mRNA decay, NMD)作用来调节蛋白的相关功能, 但这些现象尚未在低等生物的 ABCT 研究中 发现。该文以单细胞原生动物——嗜热四膜虫为对象, 利用转录组数据发现 ABCC10 基因存在可变剪切, 并产生 两条转录本(SV1 和 SV2), 其中 SV2 在第五个内含子处发生内含子保留事件, 这段长 49 bp 的序列使 SV2 发生移 码并产生 PTC 。在构建NMD 通路中关键因子 UPF1 基因的嗜热四膜虫敲降株的基础上, 利用实时荧光定量 PCR 方法检测 SV2 的转录情况。结果显示：含有PTC 的转录本 SV2 在 UPF1 敲降株中的转录水平相对于野生型显著 增加, 说明 SV2 可被 NMD 通路降解。这与高等动物中某些 ABCC 蛋白通过可变剪切引入含 PTC 转录本, 并能被 NMD 降解的方式一致, 推测该方式在真核生物中十分保守, 并在真核生物的共同祖先(the last eukaryotic common ancestor) 中就已形成。 关键词：嗜热四膜虫; ABC 转运蛋白; 可变剪切; 实时荧光定量 PCR; NMD 中图分类号：Q959.117; Q513 文献标志码：A 文章编号：0254-5853-(2011)06-0605-06 Alternative splicing of an ATP-binding cassette transporter ABCC10 in Tetrahymena thermophila 1,2 1,2 1 1,* LU Xing-Yi , XIONG Jie , YUAN Dong-Xia , MIAO Wei (1. State Key Laboratory of Freshwater Ecology and Biotechnology, Inst