基因测序问题总结总结概括.ppt

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2018-04-02 发布于天津
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基因测序问题总结总结概括.ppt

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实验中出现的问题总结 1.Panel不能导入 marker repeat marker repeat Amlogenin 6 D16S539 4 vWA 4 FGA 4 D21S11 4 D3S1358 4 D18S51 4 TH01 4 PentaE 5 D8S1179 4 D5S818 4 TPOX 4 D13S317 4 CSF1P0 4 D7S820 4 PentaD 5 弹出的对话框显示为: Invalid marker repeat in line #5 for marker Amlogenin valid marker repeat are 2，3，4 9 2.Matrix 不通过的原因（1）Insufficient number of dye spectra detected! （2）Low signal/noise：Check for failed injection. （3）Bad dye order detected. （4）Saturated data detected. （5） q=0.92860 is less than minQ threshold (0.95000) （6）选择了不适合Dye set的Module （1）Insufficient number of dye spectra detected! （6）选择了不适合Dye set的Module 3.染料堆积(Amlogenin、 vWA、D13S317、TH01位点） 4.不同颜色峰峰高均衡性不好 28个循环，chelex提取，滤纸上的血斑和唾液斑 5. TPOX位点前的非特异性扩增峰 6.扩增中产生的问题（1）加A不完全，可能和模板量过高有关或体系中含有反应抑制物等 (2)位点丢失：模板量过低或模板已降解。 (3)小片段位点优势扩增而大片段位点扩增效率低 (4)峰值过饱和 (5)Pull-up峰： (6) ladder污染?扩增产生？