美洲茶藨子查耳酮合成酶基因电子克隆和生物信息学分析-中国药师.pdf

美洲茶藨子查耳酮合成酶基因电子克隆和生物信息学分析 １，２ ２ ２ ２ 　 　 　 　（１． 　 １５３０００；２． ） 任伟超 温东 赵锐 马伟 伊春林业科学院 黑龙江伊春 黑龙江中医药大学药学院 　 　 ： 。 ： 摘 要 目的 对美洲茶藨子查耳酮合成酶基因进行电子克隆及生物信息学分析 方法 以黑茶藨子查耳酮合成酶基因序 （ ）， ＣＡＰ３ ， 。 ： 列和美洲茶藨子表达序列标签为基本材料 探针 运用 在线软件进行序列拼接 并对其进行了生物信息学分析 结果 １４２３ｂｐ， １１７３ｂｐ ， ３９０ ， 美洲茶藨子查耳酮合成酶基因全长 包含 的开放阅读框 编码 个氨基酸 该蛋白是定位于细胞质的亲水 ， ，  。 ： 性蛋白 存在三处跨膜区 二级结构主要由α螺旋构成 结论 研究结果有利于美洲茶藨子查耳酮合成酶基因的分子作用机 制等方面的研究。 　 ； ； ； 关键词 美洲茶藨子 查耳酮合成酶 电子克隆 生物信息学 中图分类号：Ｑ９４９．７５１．２　文献标识码：Ａ　　文章编号：１００８０４９Ｘ（２０１７）１２２１０６０４ ＩｎＳｉｌｉｃｏＣｌｏｎｉｎｇａｎｄＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＣｈａｌｃｏｎｅＳｙｎｔｈａｓｅＧｅｎｅｆｒｏｍＲｉｂｅｓＡｍｅｒｉｃａｎｕｍ １，２ ２ ２ ２ ＲｅｎＷｅｉｃｈａｏ ，ＷｅｎＤｏｎｇ，ＺｈａｏＲｕｉ，ＭａＷｅｉ（１．ＹｉｃｈｕｎＡｃａｄｅｍｙｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙＳｃｉｅｎｃｅ，ＨｅｉｌｏｎｇｊｉａｎｇＹｉｃｈｕｎ１５３０００，Ｃｈｉｎａ；２． ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，ＨｅｉｌｏｎｇｊｉａｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃｉｎｅ） ＡＢＳＴＲＡＣＴ　Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ：ＴｏｓｔｕｄｙｔｈｅｉｎｓｉｌｉｃｏｃｌｏｎｉｎｇａｎｄｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｏｆｃｈａｌｃｏｎｅｓｙｎｔｈａｓｅｇｅｎｅｆｒｏｍＲｉｂｅｓａｍｅｒｉｃａｎｕｍ．Ｍｅｔｈ ｏｄｓ：ＲｉｂｅｓｎｉｇｒｕｍｃｈａｌｃｏｎｅｓｙｎｔｈａｓｅｓｅｑｕｅｎｃｅａｎｄＲｉｂｅｓａｍｅｒｉｃａｎｕｍｗｅｒｅｃｌｏｎｅｄｂｙｒｅｔｒｉｅｖｉｎｇｔｈｅＥＳＴｄａｔａｂａｓｅａｓｔｈｅｑｕｅｒｙｉｎｇ ｐｒｏｂｅ，ｗｈｉｃｈｗｅｒｅａｓｓｅｍｂｌｅｄｂｙＣＡＰ３ｓｅｑｕｅｎｃｅａｓｓｅｍｂｌｙｐｒｏｇｒａｍ，ａｎｄｔｈｅｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｄａｔａｂａｓｅａｎｄｒｅｌａｔｅｄｓｏｆｔｗａｒｅｗｅｒｅｕｓｅｄｔｏ ｐｒｅｄｉｃｔｔｈｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅａｎｄｐｅｒｆｏｒｍｔｈｅｆｕｎｃｔｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓ．Ｒｅｓｕｌｔｓ：Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃａｌａｎａｌｙｓｉｓｓｈｏｗｅｄｃｈａｌｃｏｎｅｓｙｎｔｈａｓｅｇｅｎｅｅｎｃｏｄｅｄ１４２３ ｂｐａｎｄｃｏｎｔａｉｎｅｄａ１１７３ｂｐＯＲＦ，ｔｈｅｐｒｏｔｅｉｎｗａｓｗｉｔｈ３９０ａｍｉｎｏａｃｉｄ，ｗｈｉｃｈｗａｓａｈｙｄｒｏｐｈｉｌｉｃｐｒｏｔｅｉｎｌｏｃａｔｅｄｉｎｃｙｔｏｐｌａｓｍｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｔｈｒｅｅｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅｒｅｇｉｏｎｓｗｉｔｈｔｈｅｓｅｃｏｎｄａｒｙｓｔｒｕｃｔｕｒｅｃｏｍｐｏｓｅｄｏｆａｌｐｈａｈｅｌｉｘ．Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ：Ｔｈｅｓｔｕｄｙｉｓｈｅｌｐｆｕｌｔｏｔｈｅｆｕｒｔｈｅｒｅｘ ｐｌａｎａｔｉｏｎｆｏｒｔｈｅｍｏｌｅｃｕｌａｒｆｕｎｃｔｉｏｎｍｅｃｈａｎｉｓｍｏｆｃｈａｌｃｏｎｅｓｙｎｔｈａｓｅｇｅｎｅｆｒｏｍＲｉｂｅｓａｍｅｒｉｃａｎｕｍ． ＫＥＹＷＯＲＤＳ　Ｒｉｂｅｓａｍｅｒｉｃａｎｕｍ；Ｃｈａｌｃｏｎｅｓｙｎｔｈａｓｅ；Ｉｎｓｉｌｉｃｏｃ