上海地区常用近交系小鼠品系的单核苷酸多态性分型研究.PDFVIP

Animaland Medicine 25 Feb．2017．37(1) 实验动物与比较医学LaboratoryComparative doi：10．3969／j．issn．1674—5817．2017．01．006 上海地区常用近交系小鼠品系的 单核苷酸多态性分型研究 韩琳t，谢建云2，杨斐3，胡樱3，田立立z，鲍世民- (1．上海斯莱克实验动物有限责任公司，上海201615； 2．上海实验动物研究中心，上海201203 3．复旦大学实验动物科学部，上海200032) [摘要]目的比较上海地区常用近交系小鼠单核苷酸多态性(SNP)位点分型情况。方法采用多 位点进行分型检测，同时，随机选取上海地区2个近交系品系作为双盲样本，对分型方案进行验 证，差异位点利用测序法进行验证。结果 同一来源的10个近交系小鼠，同品系间SNP分型结 个位点上分型结果均相同，CBA和C57BL／6分别在7个和2个位点存在差异；差异位点经测序验 证结果与SNP分型方案一致。结论上海地区常用近交系小鼠中，同一来源的品系中SNP遗传 质量具有良好稳定性和一致性，不同种群来源的相同品系间SNP分型存在差异。 [关键字]近交系小鼠；遗传监测；单核苷酸多态性(sNP)分型 实验动物的遗传背景和反应特性是影响实验结 将SNP检测技术运用于近交系小鼠遗传质量检测和 果的重要因素，遗传的变异，或者不同亚系之间 易混淆品系或不同亚系间的鉴定[2-a1，并在相应网站 的差异，都会造成实验结果的差异，甚至出现错 (如Pubmed等)提供了大量的位点信息数据库【5】。然 误结果。随着生物医学的发展，对实验动物质量 而国内实验动物生产或使用单位在采用分子生物学 的要求越来越高，因而对实验动物质量的遗传监测 标记检测时，检测位点信息较少，检测技术操作 繁琐，工作量较大【6，训，常常不能进行全面和大规 方法也提出了更高的要求。单核苷酸多态性(single nucleotide 模的实验动物遗传特性分析监测。本文采用灵敏度 polymorphism，SNP)作为新一代的分子 标记，具有分布广泛，遗传稳定，易于自动化技 术筛选等特性【¨，多应用于人类基因鉴定，细菌病 区常用近交系小鼠44个SNP位点，以提供全面准 毒鉴定等，许多国外实验动物科研机构和实验室亦 确的近交系小鼠遗传特性。 1材料与方法 叫女稿日期]2016—09—30 [基金项目】上海市科学技术委员会科研计划项目 1．1材料 (14140900800) 1．1．1实验动物 [作者简介】韩琳(1982．)，女，硕士，实验师，研究方向：实 验动物遗传质量控制，PDX肿瘤模型。 E．mail：hanlin594@126．corn SJL／J小鼠，各品系3只，来自上海斯莱克实验动 [通讯作者]鲍世民，男，副研究员，研究方向：实验动物遗传育 种和质量控制。E—mail：baoshimin@sibs．ac．cn 万方数据 Animaland Medicine 26 实验动物与比较医学LaboratoryComparative C3H／He，CBA，129S1小鼠，各品系3只，来自1．2．5部分SNP位点测序验证对需测序验证的位 上海西普尔．必凯实验动物有限责任公司(以下简称 点进行PCR扩增反应，反应体系，反应程序同1．2．2。 BK)[SCXK(沪)2013．001616周龄雄性C57BL／6，将PCR产物送上海捷瑞生物工程有限公