极端的环境微生物期末总复习.doc

极端环境微生物-期末复习资料 绪论+01 1.环境微生物学研究的主要内容：微生物分布地点多样性和生命活动的热力学可能性。 2.从微生物与环境协同演化可解释不同环境微生物的生态学功能和代谢机制。 3.微生物推动生物地球化学过程的核心问题是：能量需求和物质循环。 4.生命需满足的条件：代谢需求，复制与进化需求。 支撑生命系统的关键条件：营养源、能源。 高效率极端生命系统的前提：极端环境、基因组重复。 5.微生物特点：个体小、结构简、食谱广、繁殖快、易培养、数量大、分布广、种类多、级界宽、易变异、抗性强、休眠长、起源早、发现晚。 6.元素的生物地球化学循环，维持土壤、沉积物、水体、大气的化学组成。 7.微生物基因组所记录的信息反应了某一时期的选择压和资源丰富程度，这和我们地球的环境之间有很大的联系。 8.进化的压力可以从微生物基因组记录的分子、代谢、生理特点看出。 9.环境微生物研究依赖于多学科交叉，实验室与现场研究并重。 10.环境微生物研究方法： 采样--样品生化活性分析--根据菌种特性进行纯培养--物理、化学、生物等宏观方面分析（生长、能量利用、代谢机制、酶活性）--遗传层面分析（突变、重组）--分子生物学分析（测序、解析分子机制） 11.环境微生物学研究受研究方法的制约，新的方法和技术体系的发明不断的拓展研究的广度和深度。 12.极端微生物的定义： 嗜酸菌 PH=3 嗜碱菌 PH=9 嗜盐菌 salt=0.2M 嗜热菌 60~80 超嗜热菌 T=80 嗜冷菌 T=15 岩下生长菌、耐金属菌、抗辐射菌、耐毒菌、耐旱菌 13.重要极端微生物研究计划 ①IODP(Integrated Ocean Drilling Program )综合大洋钻探计划 查明深海海底的深部生物圈和天然气水合物，理解极端气候和快速气候变化的过程，了解构造板块移动，揭示地震机理。 ②DEBI(The Dark Energy Biosphere Institute) ③The Deep Dark Biosphere ④ENERGY TRANSFER AND CHEMOSYNTHETIC CARBON FIXATION AT DEEP-SEA VENTS ⑤Deep Underground Science and Engineering Laboratory 14.全球环境变化是地球科学的一大主题。 重大地质环境的突变因而是地球演化的关键：极端气候事件、成氧事件、缺氧事件、生物大灭绝。 15.土壤：经过生物风化作用的改造而富含腐殖质的残积物。 16.有了生命的作用，海洋系统从太古代的无氧转变成到显生宙的有氧状态。 环境突变：碳循环异常、动物大灭绝、微生物泛滥、海洋水化学。 17.在地质时期，微生物通过碳循环、硫循环等作用于地质环境。 18.火成岩igneous rock：地球深处的岩浆侵入地壳内或喷出地表后冷凝而形成的岩石。可用放射性同位素分析。 水成岩Sedimentary：又叫沉积岩，由成层沉积的松散沉积物固结而成的岩石。 19.早期地球环境与生命过程研究的难点：需要能结合化石与基因组的活细胞证据。 现有手段：微化石、生物标记物、元素标记、分子钟。前三者都稀少且不完全可靠。分子钟则受很多因素的影响。 20.位于进化树根部的现代微生物记录了早期生命过程。 去除基因横向转移与基因组重复的影响，我们就能获得“早期”基因组活化石。 21.活化石Living Fossils：出现于地史时期而至今犹存的生物。 Horseshoe crab，Latimeria矛尾鱼，Ginkgos银杏树。 成为早期活化石需要具备的条件：生存环境长期未发生较大变化、代谢能反映早期的环境、要有特殊的基因（如重复基因）保证其度过一些重大的地质环境巨变期。 22.现代热液生态系统被认为与早期地球环境相似，且满足生命起源所需的代谢需求（氢气、甲烷、Fe-S矿）、复制需求和成膜需求。 Thermococcales是热液区优势古菌，位于进化树的根部。Thermococcales core genome大小为988基因。 23.早期生命的基因组大小范围的研究方法 筛选超嗜热古菌--基因组测序--比较基因组分析--核心代谢网络模拟--基因组删除与点突变分析(构建人工基因池)+类元祖基因组和补丁基因组分析(构建数据化基因池)--确定早期异样生命基因组大小范围。 已知能生存的天然微生物最小基因组：1400个基因； 通过可培养微生物全基因组点突变证实不可缺少的400个; 基于古菌基因组序列分析996个。 24.Pyrococcus yayanosii CH1是目前世界上唯一一株获得纯培养超极端专性嗜热嗜压古菌，其最适温压指示其来源于海底约300米以下深部生物圈。 大约1000个基因, 已证实其能依赖