05蛋白质的结构与功能99.pptVIP

第五章 蛋白质的结构与功能 第一节 研究蛋白质空间结构的方法 第二节 蛋白质的二级结构 第三节 纤维状蛋白质 第四节 球状蛋白质和三级结构 第五节 寡聚体蛋白质和四级结构 第六节 蛋白质空间结构与功能的关系 第五章 蛋白质的结构与功能 【授课时间】 6学时 【教学目标】 1、掌握?-螺旋、?-折叠和胶原的结构特征，二级、三级和四级结构概念，维持蛋白质空间结构的主要作用力 2、熟悉肌红蛋白和血红蛋白结构特征以及它们的氧饱和曲线和镰刀型细胞贫血病的起因 第五章 蛋白质的结构与功能 【教学内容】 （1）蛋白质存在着四种水平的结构（蛋白质一级、二级、三级和四级结构） （2）肽链在构象上受到很大的限制（?-螺旋，?－折叠，胶原结构） （3）肌红蛋白是第一个被确定具有三级结构的蛋白 （4）球蛋白的折叠依赖于各种相互作用，变性剂可引起蛋白质去折叠 （5）具有四级结构的蛋白质是球状亚基的组装体（血红蛋白是个四聚体蛋白， 血红蛋白和肌红蛋白的氧合曲线不同，血红蛋白是个别构蛋白，镰刀型细胞贫血病是一种分子病） 蛋白质空间构象 指蛋白质多肽链主链在空间上的走向及所有原子和基团在空间中的排列与分布。 蛋白质的空间结构包括二级结构，三级结构，四级结构。 1、二级结构 多肽主链中各个肽段借助于相邻氨基酸之间的氢键形成的构象。主要有α-螺旋、β折叠、β-转角、无规卷曲。 1.1 超二级结构： 由两个以上二级结构单元相互聚集形成的有规则的二级结构的组合体如αα，βαβ，βββ 1.2 结构域 大的球蛋白分子中，多肽链形成几个紧密的球状构象，彼此以松散的肽链相连，此球状构象是结构域，结构域是多肽链的独立折叠单位，一般由100-200个氨基酸残基构成。 蛋白质空间构象 指蛋白质多肽链主链在空间上的走向及所有原子和基团在空间中的排列与分布。 蛋白质的空间结构包括二级结构，三级结构，四级结构。 2、三级结构 整条多肽链或亚基通过盘旋、折叠，形成紧密的、借各种次级键维持的球状构象。 3、四级结构 寡聚蛋白中亚基种类、数目、空间排布及亚基间相互作用力。 单链蛋白质只有一、二、三级结构，无四级结构。 第一节 研究蛋白质空间结构的方法 X-射线晶体衍射法 可用来研究处在晶体状态下的蛋白质的空间结构。 核磁共振(NMR)光谱法 可用来研究处在溶液状态的蛋白质的结构。 第五章 蛋白质的结构与功能 第一节 研究蛋白质空间结构的方法 第二节 蛋白质的二级结构 第三节 纤维状蛋白质 第四节 球状蛋白质和三级结构 第五节 寡聚体蛋白质和四级结构 第六节 蛋白质空间结构与功能的关系 第二节 蛋白质的二级结构 一、肽基（peptide group）的结构 二、多肽链主链的构象可以用它们扭角来描述 三、多肽允许的构象可以用拉氏构象图预测 四、蛋白质的二级结构 一、肽基的结构 肽基（peptide group）即肽键。 结构特点： 1）、肽键具有部分双键的性质。 一般地，C－N键长：0.184nm，具40％双键性质； C＝N键长：0.127nm，具40％单键性质； C N（酰胺键）键长：0.132nm 2）、组成肽键的4个原子和2个相邻的Cα在同一个平面上（称为酰胺平面或肽平面） 3）、肽键可以是反式，可以是顺式。但除脯氨酸的-NH2参与形成的肽键外，其余的肽平面上，两个Cα都是处于更稳定的反式构象，即反式稳定。 二、多肽链主链的构象可以用它们扭角来描述 肽平面 肽键的所有4个质子和与之相连的2个Ca均在同一平面内. C=O与N-H呈反式排列，键长，键角固定 Ca-N1，Ca-C2单键，可自由旋转，形成二面角（Φ角、Ψ角） 二、多肽链主链的构象可以用它们扭角来描述 二面角（扭 角） 多肽链的所有可能构象都能用Φ、Ψ这两个扭角描述。 规定：Φ的旋转键N1-Ca两侧的N1-C1和Ca-C2呈顺式时，Φ=0. Ψ的旋转键Ca-C2两侧的Ca-N1和C2-N2呈顺式时，Ψ=0。 Φ角--绕C2-N1键旋转的角度 Ψ角--绕Ca-C2键旋转的角度 Φ、Ψ -180--+180 三、多肽允许的构象可以用拉氏构象图预测 从理论上讲，一个多肽主链能有无限多种构象。 但是，只有一种或很少几种天然构象，且相当稳定。因为：天然蛋白质主链上的单键并不能自由旋转。 Φ和Ψ同时为0的构象实际不存在 二面角（Φ、Ψ）所决定的构象能否存在，主要取决于两个相邻肽单位中非键合原子间的接近有无阻碍。 Cα上的R基的大小与带电性影响Φ和Ψ 蛋白质中非键合原子间的最小接触距离 拉氏构象图 Ramachandra