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第五章DNA生物合成

DNA具有储存、传递(包括复制、转录、翻译)和接受(反转录)遗传信息的功能。 DNA的生物合成包括DNA的复制、损伤修复和重组。 DNA复制是保持DNA分子的忠实拷贝过程,具有高度的忠实性,DNA修复和重组是影响遗传信息本身结构的调整过程,保持遗传信息的完整性。 一. DNA的半保留复制 (一)概念 DNA生物合成时,母链DNA解开为两股单链,各自作为模板(template)按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。 子代细胞的DNA,一股单链从亲代完整地接受过来,另一股单链则完全从新合成。两个子细胞的DNA都和亲代DNA碱基序列一致。这种复制方式称为半保留复制。 4)大肠杆菌DNA聚合酶 Ⅳ和Ⅴ 1999年发现DNA聚合酶 Ⅳ和Ⅴ,参与DNA的错误倾向修复。 当DNA受到严重损伤时,正常的DNA聚合酶在该处不能形成正确的碱基配对而停止修复,此时诱导产生这两种酶,能在损伤部位继续复制,但修复的准确性较差,会造成较高的突变率,这虽然会杀死许多细胞,但至少可以克服复制障碍,使少数突变的细胞得以存活,从而延续种系。 (三)与DNA的复制过程有关的其他酶和蛋白质因子 (以大肠杆菌为例 ) 除DNA聚合酶外,还需要20多种不同的酶和蛋白质因子的参与,整个复合物统称为DNA复制酶系统(DNA replicase system)或者复制体(replisome)。 解旋酶(helicase) :DNA复制时,解旋酶沿着DNA母链滑动使之解旋,同时打开双链之间的氢键,这一过程所消耗的化学能通过ATP水解提供。 (三)与DNA的复制过程有关的其他酶和蛋白质因子 (以大肠杆菌为例 ) 拓扑异构酶(topoisomerase) :用于消除螺旋状DNA解旋时产生的拓扑应力。拓扑异构酶I主要集中在活性转录区,与转录有关;拓扑异构酶II分布在染色质骨架蛋白和核基质部位,同复制有关。 单链DNA结合蛋白(single strand DNA binding protein, SSB) 引物酶(primase) :促使引物合成 。 DNA连接酶(DNA ligase) 图5-9. 大肠杆菌起始点oriC的复制引发模型 A. 约20个各带1个ATP 的DnaA蛋白 结合于 9bp序列,使DNA围 绕着复合物卷成一圈 B.三个富含A=T的 13bp重复序列被变性 C.在DnaC蛋白 的帮助 下DnaB蛋白进一步 使DNA解螺旋,以 备引物和DNA的合成 表5-3大肠杆菌复制起始点引发DNA复制所需的蛋白质 (二)延伸 DNA的两条链都能作为模板。 由于DNA分子的一条链的走向为3′→5′,另一条链为5′→3′;而所有已知DNA聚合酶的合成方向都是5′→3′。 为了解决这个矛盾,1968年,日本学者Okazaki等提出了DNA的不连续复制模型,认为: 沿3′→5′模板链合成的子链是连续合成,而沿5′→3′方向合成的子链是分段合成,由许多DNA片段连接起来的。 1、冈崎片段和半不连续复制 以复制叉向前移动的方向为标准,一条模板链是3′→5′走向,在其上DNA能以5′→3′ 方向连续合成,称为前导链(leading strand); 另一条模板链是5′→3′走向,在其上DNA也是从5′→3′ 方向合成,但是与复制叉移动的方向正好相反,所以随着复制叉的移动,形成许多不连续的片段,最后连成一条完整的DNA链,该链成为滞后链或后随链(lagging strand)。 冈崎片段(Okazaki fragment): 在不连续的后随链DNA合成中形成的DNA短片段,在原核生物为1000~2000核苷酸,真核生物约100~200核苷酸。1968年冈崎发现。 (三)终止 复制的最后,大肠杆菌染色体的两个复制叉在终止区域相遇,这个区域含有20个碱基对序列,叫做Ter序列(Terminus,终止的意思)。该序列排列在染色体上造成一种陷阱,即复制叉到此就停止不再向前进行。 Ter序列的功能是结合一种叫做Tus的蛋白质(terminus utilization substance, 即终止利用物质). Tus-Ter复合体能够阻止单方向前进的复制叉,该复合体只能对一个复制叉起作用。 (三)终止 当一个复制叉遇到Tus-Ter复合体时,复制停止;另一复制叉在遇到已停止的复制叉时复制也随之停止。最后的数百个位于这些大的蛋白质复合体之间的碱基对尚没被复制。 其后两条亲代母链解开,通过修复方式填补空缺,形成了两个交联在一起的环状染色体。这种拓扑互联环称为连环体(catenane), 大肠杆菌的交联DNA环的分离需要拓扑异构酶IV(一种II型拓扑异构酶),分离开的染色体在细胞分裂时分别进入子细胞。包括真核生物的DNA病毒

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