塔吉克斯坦哈特隆州土壤可培养细菌多样性分析.PDFVIP

第39 卷 第1期 Vol. 39 No. 1 2016 年1月 ARID LAND GEOGRAPHY Jan. 2016 塔吉克斯坦哈特隆州土壤可培养细菌多样性分析② 1，2 1，2 1，2 1 1 谢汶芝 ， 罗明 ， 韩剑 ， 铁展畅 ， 杨伟翔 ， 巴依木热杜夫.Р.Б， 卡迪洛夫·K·G3 3 （1 新疆农业大学农学院，新疆 乌鲁木齐 830052 ； 2 新疆自治区高校农林有害生物监测与安全防控重点实验室， 新疆 乌鲁木齐 830052 ； 3 塔吉克斯坦农业大学，塔吉克斯坦，杜尚别 ） 摘 要： 采用纯培养、结合核糖体DNA 扩增片段限制性酶切分析（16S rDNA PCR-RFLP ）、Rep- PCR 及16S rDNA 序列测定和系统发育分析方法研究塔吉克斯坦哈特隆州土壤可培养细菌群落结 构和种群多样性。从哈特隆州的农田、天然草地、林地及荒漠土壤中分离获得110个菌株，分布在 厚壁菌门（Firmicutes ）（80.9% ）、变形杆菌门（Proteobacteria ）（17.2% ）和放线菌门（Actinobacteria ） （1.85% ）三个类群中，归属于芽孢杆菌（Bacillus ）、寡养单胞菌（Stenotrophomonas ）、短杆菌（Brevi- bacterium ）、节杆菌（Arthrobacter ）、棍状杆菌（Clavibacter）、短波单胞菌（Brevundimonas ）、贪食菌 （Variovorax）、假单胞杆菌（Pseudomonas ）、芽孢八叠球菌（Sporosarcina ）、赖氨酸芽孢杆菌（Lysini- bacillus ）、无色杆菌属（Achromobacter ）和Rheinheimera 共12个属中。其中Bacillus （71.8% ）为该地 区土壤可培养细菌绝对优势种群，Pseudomonas （10.9% ）为次优势种群。对优势种群Bacillus 的 Rep-PCR 基因组指纹图分析表明，63 株分离物有17 种不同的多态性指纹图谱，具有较为丰富的多 样性特征。不同样地土壤中可培养细菌的种群分布、结构组成及多样性存在明显差异，与土壤环 境密切相关。Shannon 多样性指数、Simpson 优势度和Pielou 均匀度指数与土壤有机质、全氮、碱解 氮及含水量呈显著正相关（p 0.05 ）。土壤速效钾含量也是显著影响细菌Shannon 多样性、Simpson 优势度的重要因素。研究不仅为后期功能菌株的筛选提供了基础，也为塔国不同土地利用方式下 土壤环境评价提供了依据。 关 键 词： 塔吉克斯坦；纯培养；16S rDNA ；RFLP ；Rep-PCR 中图分类号： Q939 文献标识码：A 文章编号：1000-6060（2016 ）01-0144-10（144 ～153） 土壤微生物是土壤中物质形成与转化的关键动 前，对土壤微生物多样性的研究手段有多种，主要 力，在保育土壤肥力、影响土壤植被和维护土壤健 包括基于分离培养的多样性评估和基于土壤DNA/ ［3 ］ 康，调控生态安全等方面起着不可替代的作用。土 RNA 分析的免培养分子生物学分析技术 。分离 壤是自然环境中最为复杂的异质体系，决定了土壤 培养方法可直观地获取菌株的形态、生理特性、遗 ［1］ 微域环境的多样化和土壤微生物的高度多样性 。 传机制、代谢功能及对环境响应等信息，还可得到 研究在自然或人为干扰、环境变更