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iCycler iQ荧光定量PCR仪装机几点注意事项
iCycler iQ装机和升级的几点注意事项
配套电脑的设置
并口输出模式:iCycler iQ的optical module与配套电脑连接通过并口。要求在电脑启动后进入Bios设置,在并口输出模式(parallel port mode)一栏中选择EPP。
语言和显示器设置:在“控制面板”下,“语言”选项内,将语言首选项选择为英语。显示器的分辨率设置为1024*768,屏幕保护程序设置为“无”。
在启动Icycler软件之前,关闭“防病毒”“金山词霸”等实时软件。
Mask与Purdy:
将iCycler安装完以后,必须进行Mask(对光路)和Purdy(纯染料校正)调节后才能进入使用状态。
Mask
Mask的目的是将96个检测点的位置与96个反应孔的位置一一对应,保证荧光收集的准确性。步骤如下:
取iCycler iQ Solution Kit(170-8792)中的External Well Factor Solution(10×)一支(棕色管盖),吸取液体0.5ml,放入一个至少5ml的干净试管中,再加入4.5ml蒸馏水,充分混匀备用。
取iCycler iQ PCR Plates(223-9441)一块,在其96个孔中各加入稀释好的External Well Factor Solution(1×)50μl。
加样后,在板上盖一块干净的光学级封带(Optical-quality sealing tape,223-9444),用刮板刮几下,使封胶与板粘紧。这块准备完的板就叫做External Well Factor Plate 。
将External Well Factor Plate 放入机器,盖好盖。打开系统软件,进入“Run- time central”中的Imaging Services窗口;
点击“Optimize Bias”使荧光信号探测器进入最佳工作位置。完成后“Bias”文件框会显示其调整值,再点击该文件框下方的“Save Bias”键保存其设置;
点击窗口右下方的“Home Filters”键使滤光镜组归回原位;
在“Position Filters”文件框中选择要使用的滤光镜组在选择转轮上的位置选项(一般选择2,既FAM滤光片),在“Select Exposure”文件框中选择适当的曝光长度(一般选择640ms,“count” 文件框选择“1”);
点击“Make an Exposure”键。窗口左上方会显示出一幅反应板图象。在该图象上检查有没有孔像素饱和(如果有孔已经饱和,该孔会显示红紫色)。如果发现有孔像素饱和,在“Select Exposure”文件框中减少其曝光长度直到全部96孔全都没有饱和为止。如果没有发现像素饱和,逐渐增加曝光长度直到有孔出现饱和,然后再减少到其没有像素饱和出现的最大曝光长度;
按住键盘上的“Shift”键,点击反应板图象上的A1孔(最左上的那个孔),打开mask文件。您也可以在上方文件框中选择“Show Masks”,然后通过点击窗口上方的方向键选中A1;
点击“Optimize Mask Positions”键,系统会自动调整遮光框到最佳工作位置。无论调整完成或调整失败,系统都会显示相应信息。如果调整失败,重复该步骤一次,如果再次失败,只能使用手动调节(见下文);
遮光框调整完成后,点击“Save Optimized Masks”键。本次调整结果被保存在mask96.ini 文件中(c:\Program file\Bio-Rad\iCycler\ini)。
External Well Factor Plate 使用后,保留在仪器中,继续下面的PURDY。
注意:如果想调整某个孔的遮光框位置,点击反应板图象上的相应孔,其显示色会由绿变蓝,此时点击图象上方的各方向箭头键即可调整其遮光框位置。图象右上方的“Average inner fluorescence”显示该孔的内方格读数,“Average outer fluorescence”显示该孔外方格读数,“Saturated pixel count”显示该孔的像素饱和度。点击图象内该孔外的任何位置,系统会保存对其的调整,同时该孔显示色由蓝变绿,相应读数和功能键恢复到针对整个反应板的状态。
Mask窗口简介
窗口顶部的箭头键用来手调遮光框的位置;窗口右上部的数据分别代表反应板全部96孔平均遮光框内矩阵(Inner )、外矩阵(Outer)读数和已经像素饱和的孔数(Satutated)。用户如果点击96孔模拟布局图上的某孔后,该孔在布局图上会变蓝,而上述三个数据也就分别显示该孔的遮光框内方格、外方格的读数和像素饱和度。
窗口右侧可以选择滤光镜选择转轮上的位置(Position Filters)和曝光长度(Select expos
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