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- 2018-04-24 发布于天津
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20第十九章节 遗传信息传递的整体性.ppt
(三)推断未知基因功能,探索生命机制 转录组分析可以提供特定条件下(生理、病理、诱导刺激等)基因表达的信息,通过使用基因碱基序列数据和比较已知及未知功能的基因,推断相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制。 三、芯片、SAGE和MPSS是转录组学研究主要技术 转录组学研究重点: 基因转录的区域 转录因子结合位点 染色质修饰点 DNA甲基化位点等 研究技术: 微阵列(microarray) SAGE MPSS (一)微阵列是大规模基因组表达谱研究的主要技术 微阵列或基因芯片(DNA chip)原理 利用光导化学合成、照相平板印刷以及固相表面化学合成等技术,在固相表面合成成千上万个寡核苷酸探针,并与放射性同位素或荧光物标记的来自不同细胞、组织或整个器官的DNA或mRNA反转录生成的第一链cDNA进行杂交,然后用特殊的检测系统对每个杂交点进行定量分析。 优点:可同时对大量基因,甚至整个基因组的基因表达进行对比分析。 微阵列技术的基本步骤 (二)SAGE在转录物水平研究细胞或组织基因表达模式 SAGE的基本原理: 用来自cDNA 3‘端特定位置9~10 bp长度的序列所含有的足够信息鉴定基因组中的所有基因 利用锚定酶(anchoring enzyme,AE)和位标酶(tagging enzyme,TE)切割DNA分子的特定位置(靠近3’端),分离SAGE标签,并将这些标签串联起
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