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基因组印记和研究方法.ppt
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基因组印记与研究方法
报告人 : cgl
2006年10月17日
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主要内容
1 基因组印记与印记基因
2 印记基因的特征
3 可能的印记机制
4 基因组印记与疾病
5 基因组印记研究方法
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1 基因组印记与印记基因
1 Genomic imprinting is a phenomenon in which alleles of a gene are expressed differentially depending on their parental origin.
Those whose expression is dependent on the parental origin of the allele are known as imprinted genes.
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印记基因中来自双亲的两条等位基因只有一个表达,另一个不表达或表达甚微。
母系印记:母本等位基因沉默(父本表达)的印记 基因称为母系印记基因。如:Igf2 ,Ins , Ndn.
父系印记:父本等位基因沉默的印记基因称为父系 印记基因。如:Cpa4, H19,Cd81.
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目前在昆虫、植物、在真兽哺乳亚纲动物(eutherian mammals)和有袋类动物(marsupials)中发现了印记现象;而在单孔类(monotremes)和鸟类中没有发现印记现象。
目前在小鼠和人上已经发现了100多个印记基因(印记转录单元)。见表
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2 印记基因的特征
2.1 印记基因常成簇存在。如印记基因Mash2、Ins、Igf2、H19位于染色体上不到400kb的范围内。
如小鼠7号染色体 p57KIP2, KvLQT1 and Mash2---Insulin-2(Ins-2) and Igf2---H19。
人15号染色体: ZNF127 --SNRPN---IPW (encodes RNA) 。
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2 .2印记基因复制的异步性。
Igf2-H19区域的复制:父源等位基因复制早于母源等位基因。
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2.7 印记基因在真兽哺乳亚纲动物保守。在小鼠中发现的印记基因一般在其他哺乳动物也表现印记特征,但少数基因例外(Cd81、Igf2r)。见表
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3可能的印记作用机制
3.1 DNA甲基化
DNA甲基化是一种DNA结构修饰。它 一般和基因沉默相关联,去甲基化常和沉默基因的重新激活有关。
DNA甲基化的转录调控可能参与哺乳动物基因组印记的产生。
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在印记区域亲本等位基因一般存在甲基化差异,这些区域称为差异甲基化区( differentially methylation region ,DMR)。
DMR 在调控基因印记中起重要作用。
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Igf2-H19 的印记机制:
Igf2-H19 区域定位于小鼠7号染色体、人11号染色体。
Igf2 编码胎儿的一个生长因子,父本等位基因表达。
H19的转录物是功能未知的非编码 RNA,母本等位基因表达。
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