表观遗传学简介讲解材料.pptVIP

表观遗传学简介 （Introduce to Epigenetics）;表观遗传学(epigenetics) 是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如DNA甲基化、组蛋白乙酰化等。 在基因组中除了DNA和RNA序列以外，还有许多调控基因的信息，它们虽然本身不改变基因的序列，但是可以通过基因修饰，蛋白质与蛋白质、DNA和其它分子的相互作用，而影响和调节遗传的基因的功能和特性，并且通过细胞分裂和增殖周期影响遗传的一门新兴学科。因此表观遗传学又称为实验遗传学、化学遗传学、特异性遗传学、后遗传学、表遗传学和基因外调节系统，它是生命科学中一个普遍而又十分重要的新的研究领域。 ;表观遗传有三个密切相关的含义： 可遗传的，即这类改变通过有丝分裂或减数分裂，能在细胞或个体世代间遗传； 可逆性的基因表达调节； 没有DNA序列的变化或不能用DNA序列变化来解释。;主要包括： (1)基因选择性转录表达的调控：DNA 甲基化、组蛋白共价修饰等所导致的基因组印迹、染色质重构（塑）等; (2)基因转录后的调控： 针对mRNA的调控。如基因组中非编码RNA（主要来源于内含子和转录的基因间序列）、miRNA（能够自我折叠形成发夹状结构，通过RNAi或类似于RNAi的机制起作用）、反义RNA、内含子和核糖体开关等 借以调控基因表达活性，在生殖与发育、遗传与进化、生理与病理现象中具有重要的生物学意义，表观遗传学及应运而生的人类表观基因组计划（HEP）已成为近年关注的热点问题。已知表观遗传学现象与多种人类疾病有着密切的关系，如肿瘤、基因印迹病等。同时基因甲基化异常存在可逆性，这可能为相关疾病的治疗提供崭新的途径。 ;DNA 甲基化是生物关闭基因表达的一种有效手段，也是印迹遗传的主要机制之一；基因的去甲基化可能使得印迹丢失，基因过度表达，甚至引起肿瘤或癌症的发生，如促肿瘤生长因子IGF2基因过度表达引发大肠癌。 在特定组织中，非甲基化基因表达,甲基化基因不表达,基因选择性的去甲基化形成特异的组织类型。 DNA甲基化不仅与染色质重构、转录抑制密切相关, 而且与疾病的易感性、发生发展、预后和转归均有密切关系。多种肿瘤的发生都涉及到基因组甲基化???改变, 包括抑癌基因的高/新甲基化和癌基因的低/去甲基化。 脊椎动物基因的甲基化状态有3种：持续的低甲基化状态，如管家基因；去甲基化状态，如发育阶段中的一些基因；高度甲基化状态，如女性的一条失活的X染色体。 ;DNA甲基化能关闭某些基因的活性，去甲基化则可诱导基因的重新活化和表达。甲基化的主要形式有5-甲基胞嘧啶，N6-甲基腺嘌呤和7-甲基鸟嘌呤。原核生物中CCA/TGG 和GATC 常被甲基化，而真核生物中甲基化仅发生于胞嘧啶上。DNA的甲基化是在DNA甲基化转移酶（DNMTs）的作用下使CpG 二核苷酸5’端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶，这种DNA修饰方式并没有改变基因序列，但它由此调控了基因的表达。 DNA甲基化通常是指胞嘧啶（C） 5’位碳原子的甲基化（m5C）。m5C存在于5’CpG3’二核苷酸回文结构中,CpG二核苷酸在人类基因组中只占10% ,其中70%～80%呈甲基化状态。非甲基化CpG二核苷酸主要存在于位于CpG富集区即CpG岛（CpG islands），长约几百至几千bp、GC含量达55％以上、在进化中很保守。 真核生物基因组中存在着广泛的甲基化，DNA甲基化主要发生在CpG岛上，其作用是导致基因的表达受到抑制而沉默。 CpG 岛DNA甲基化所致基因沉默是表观遗传学（epigenetics） 的主要改变之一。;(一) 全基因组范围CpG岛DNA甲基化分析 采用甲基化敏感或/和甲基化不敏感的酶（同裂酶）进行全基因组DNA范围内的酶切，在基因组消化产物的两端加上特异性的接头，然后以PCR扩增来筛选甲基化和未甲基化的CpG岛片段。 (二) 位点特异性甲基化分析 目前多采用亚硫酸氢盐作前期的基因组DNA预处理。亚硫酸氢盐修饰是众多序列特异性甲基化检测方法的基础。胞嘧啶（C）与亚硫酸氢钠的反应可以迅速鉴别出以任何序列存在的5mC，修饰后单链DNA中的C通过磺酸基作用脱氨基形成U，而CmG不变。 （三）新甲基化位点的寻找; ;组蛋白转录后的修饰，包括甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化、ADP-核糖基化等，形成了复杂的组蛋白密码（histone code），或“表观遗传学分子记忆”（epigenetic molecular memory），可以被不同细胞因子识别和在亲子代间传递。它们都是组蛋白密码的基本元素，共同参与了基因表达调控。研究发现组蛋白H3 N端的赖氨酸4（H3-K4）甲基化与基因表达的活化相关，主要存在于活化基因的启动子区；而组蛋白H3 N端赖氨酸9甲基化（H3-K9）甲基化则直接导致了中心粒周围异