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生物化学 ppt第13章 核酸的结构
2、原核细胞的拟核 3、病毒 4、核糖体 RNA和蛋白质核心 突环由双链DNA结合碱性蛋白质所组成 细菌拟核的突环结构 RNA通常是单链线形分子 自身回折形成局部双螺旋(二级结构) 进而折叠(三级结构) 多数形成核蛋白复合物(四级结构), 如核糖体、拼接体、编辑体等。 RNA病毒是具有感染性的RNA复合物 四、RNA的高级结构 RNA中的碱基配对原则 A-U G-C A-U G-C 双螺旋区 ①氨基酸臂:由7对bp组成,富含G, 末端为CCA,接受活化AA ②二氢尿嘧啶环(D环): 由8-12个核苷酸组成 ③反密码环:识别密码子 ④额外环:大小是tRNA分类的重要指标 ⑤假尿嘧啶核苷-胸腺嘧啶核苷环 (T Ψ C环) 1、二级结构 (一)tRNA的高级结构 tRNA的三叶草型二级结构 1 2 3 叶子 反密码子环 反密码子 载运氨基酸 臂 稀有碱基 D环 TψC环 额外环 四环四臂 2、tRNA的三级结构 tRNA的三级结构:倒“L”形 核糖体:rRNA+蛋白质 催化肽键合成的是rRNA , 蛋白质维持rRNA构象,起辅助作用 (二)rRNA的高级结构 大肠杆菌16s rRNA (三)其它RNA的高级结构 * DNA 一 股 的 核 苷 酸 序 列 与 另 一 股 的 序 列 互 补:A-T、G-C Franklin, Rosalind Elsie (1920-58), British biophysicist. Born in London, she was educated in physical chemistry at Newnham College, Cambridge. Franklin conducted X-ray diffraction studies on the structure of the DNA molecule, the carrier of hereditary information, while working in the laboratory of British biophysicist Maurice Wilkins. This work enabled American biochemist James Dewey Watson and the British Francis Crick to determine the helical structure of the DNA molecule. (二)DNA二级结构—B型双螺旋 James Watson (left) and Francis Crick, 1953 大 部 分 DNA 所 具 有 的 双 螺 旋 结 构 , 亦 称 为 B 型 小沟 大沟 5` 3` 5` 3` 反向、平行、右手螺旋2 链间碱基配对相连 每10个碱基对螺旋上升一周 疏水碱基位于内部 相邻碱基平面互相平行, 垂直于螺旋轴 (1)两条反向平行的 多核苷酸链围绕 同一中心轴缠绕, 为右手螺旋。 1、结构特征 (2) 碱基位于双螺旋的内侧, 磷酸和核糖在外侧, 通过3’,5’-磷酸二酯键构成骨架。 碱基平面与纵轴垂直, 糖环平面与纵轴平行。 大沟:宽1.2nm,深0.85nm,小沟:宽0.6nm,深0.75nm。 (3)主要参数 双螺旋的直径为2nm, 碱基堆积距离为0.34nm, 两个核苷酸之间的夹角36°, 每圈螺旋含10个核苷酸,螺距3.4nm。 (4)两条核苷酸链依靠碱基间形成的氢键而结合。 A=T G≡C (5)碱基在一条链上的排列顺序不受任何限制。但根据碱基配对原则,一条核苷酸链序列可决定另一条互补链的序列。 双螺旋的补充: (1)夹角和碱基对的数目变化 (2)碱基对沿长轴旋转一定的角度 ①碱基堆积力形成疏水环境(主要因素) 。 ②碱基配对的氢键。GC含量越多,越稳定。 ③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键,中和了磷酸基上的负电荷间的斥力,有助于DNA稳定。 ④碱基处于双螺旋内部的疏水环境中,可免受水溶性活性小分子的攻击。 2、稳定双螺旋结构的因素 3、DNA双螺旋结构的多样性 DNA的类型 类型 结晶状态 螺距 碱基距离 每圈 旋转
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