竹类植物与水稻等其它禾本科作物的系统进化关系及-林业科学研究.PDFVIP

林 业 科 学 研 究　2006, 19 (2) : 165～169 F ores t R esea rch 　　文章编号 : 100 11498 (2006) 02 016505 竹类植物与水稻等其它禾本科作物的系统 进化关系及基因序列组成的比较 1 1 2 樊龙江 , 郭兴益 , 马乃训 ( 1浙江大学作物科学研究所 /生物信息学研究所 ,浙江 杭州 　3 10029; 2 中国林业科学研究院亚热带林业研究所 ,浙江 富阳　3 11400) 摘要 :利用 8个全长 mRNA 基因序列比较了竹类植物和水稻等禾本科作物的系统进化和序列组成等 。结果表明 ,在 ( 与水稻 、玉米和麦类作物的比较中 ,竹类植物与水稻有着最近的亲缘关系和更相似的基因序列特征 GC含量分布和 ) 密码子使用频率 ,它们甚至比水稻与玉米或水稻与麦类之间的亲缘关系更近 。这一结果提示 ,水稻作为禾本科植 物的模式物种 ,应与竹类植物存在 良好的基因组共线性关系 ,水稻基因组序列信息对竹类植物基因组研究与分析具 有重要参考价值 。 关键词 :竹类植物 ;水稻 ;系统进化 ; GC含量 ;密码子使用频率 中图分类号 : S795　S7 1846　　　文献标识码 : A Com para tive Study on Phy logenetic s and Sequences Com position of Bam boos and Cerea ls 1 1 2 FAN L ong j iang , GUO X ing y i , MA N a ix un ( 1 In stitu te of Crop Science / In stitu te of B ioinform atic s, Zhej iang U n iversity, H angzhou　3 10029 , Zhej iang, Ch ina; 2 R esearch In stitu te of Sub trop ical Forestry, CA F, Fuyang　3 11400 , Zhej iang, Ch ina) Ab stract: Phylogenetic s and Sequence compo sition of bamboo s and cereals were analyzed based on current 8 fu lllength mRNA sequences in the pub lic nucleotides database s. The re su lts indicated that bamboo s had more shorter phylogenetic dis tance and sim ilar sequence compo sition ( GC content and codon u sage) w ith rice than other cereals. The resu lts sugge sted that rice, a