2014版 高级生物化学35.doc

蛋白质结构与功能关系 蛋白质的二级结构（secondary structure）指多肽链主链本身折叠或盘曲所形成的局部空间构象，包括依靠氢键维系的有规则构象和多肽链主链中的无规卷曲以及非氢键维系的规则结构，不涉及侧链结构和整个肽链的空间排布。 1、螺旋：多肽链主链Cα-C-N的重复排列，使它容易形成有规律的卷曲构型，即螺旋，分为α-螺旋（3.613R，即每圈约3.6个残基，每个肽键N上的H与后面第四个残基肽键羰基O之间形成氢键，其间包括13个原子，右手螺旋，是球蛋白中最常见的结构）、310R螺旋、π-螺旋等。 2、β-片层：两股或多股几乎完全伸展的肽链并列聚集，靠主肽链N上的H与相邻链羰基C上的O原子间规律的氢键，形成β-折叠片，β-折叠片有的是平行的，有的是反平行的。 3、环肽链（loop） （1）回折：肽链要折叠成坚实的球形，必须以多种方式多次改变其方向，如同一肽链形成的β-折叠股之间的连接肽。3~4个氨基酸残基通过特殊的氢键系统使肽链走向改变180°成为回折或转角，分为β-回折和γ-回折。 ①β-回折：由4个氨基酸残基组成，即第一个残基的羰基O与第四个氨基酸残基α-氨基上的H之间形成氢键。 ②γ-回折：由3个氨基酸残基组成，第一个残基的羰基O与第三个残基的α-氨基H原子间形成氢键，常出现在反平行β-折叠股之间。 （2）β发夹与β凸起： β发夹：通过一段短的环链将两条相邻的β链连接在一起的结构，称为β发夹或发夹（hairpins）结构，犹如一弯折的发卡，故名。 4、Ω环：多肽链中由6~16个氨基酸残基组成的环状片段，两端距离小于0.1nm，状似Ω字形，因此得名。Ω环形成一个内部空腔，被环上残基的侧链基团包裹，成为致密的球状构象。以亲水残基为主，几乎总是位于蛋白质分子表面，与生物活性有关。 5、连接条带：伸展的肽链条带连接在结构元件之间，它们的长度、走向颇不规则，在蛋白质肽链的卷曲、折叠过程中具有明确的结构作用。 6、无规则卷曲：蛋白质分子中存在空间结构不确定的区域，这种无序结构因其不断运动，或是具有不同的构象，因而得不到X-射线衍射图像 超二级结构（super-secondary structure）：相互邻近的二级结构单元相互聚集，形成更高一级的有规律的结构，称超二级结构，主要涉及这些构象元件在空间上如何聚集，超二级结构的形成主要是氨基酸残基侧链基团间相互作用的结果。 结构域（structural domain）二级结构和结构模体以特定的方式组织连接，在蛋白质分子中形成两个或多个在空间上可以明显区分的三级折叠实体，是三级结构的基本单位，结构域是相对稳定的球状亚结构，其间由单肽链相互连接，是独立的结构单位、独立的功能单位和独立的折叠单位。 锌指结构(Zine Finger,ZF)一种DNA结合蛋白中的结构基元，由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn2+构成，中间的X4-20形成指状凸出。锌指蛋白与DNA相互作用时，锌指部分嵌入主槽，识别特定别特定的碱基序列，每个锌指大约识别5个碱基对。 亮氨酸拉链（Leucine Zipper,LZ）LZ结构的C端为螺旋区，靠近N端一侧的一段螺旋富含碱性氨基酸残基，其后的一段螺旋每隔6个残基就有一个Leu，每个这样的螺旋不少于4个Leu，且都处于螺旋的同一侧，这样，当含有LZ的蛋白形成同源或异源二聚体时，LZ结构中的Leu残基借助疏水作用彼此靠拢，形同拉链。 EF手（EF-hand）由两个α螺旋（E和F）与连接它们的环组成，E螺旋含9个残基，用右手食指表示；与Ca2+结合的环含12个残基，用弯曲的中指表示；F螺旋含18个残基，用拇指表示。 蛋白质组学：通过直接研究某一物种、个体、器官、组织及细胞中全部蛋白质，获得整个体系内所有蛋白质组分的生物学和理化参数，从而揭示生命活动规律的科学。 分子伴侣（molecular chaperone）结合并稳定靶蛋白的不同的不稳定构象，通过控制与靶蛋白的结合与释放，推动其在活体内正确折叠、组装、运输到位，或控制其在活化与钝化构象之间转换，但并不构成靶蛋白组成部分的蛋白质。 热激蛋白（heat shock protein，Hsp）广泛存在于原核细胞和真核细胞中的一类在生物体受到高温等逆境刺激后大量表达的保守性蛋白质家族，是多基因族编码产物，有组成型和胁迫诱导的，具有分子伴侣功能，参与蛋白质新生肽链的折叠和组装。可分Hsp70、Hsp60、Hsp90、Hsp110等亚类。 热激蛋白的分子伴侣功能： 1、Hsp70的分子伴侣功能：大肠杆菌的Hsp70帮助前体蛋白维持转位能力，防止变性蛋白质进一步变性和聚集。Hsp70在线粒体前体蛋白的跨膜运输中发挥重要作用，Hsp70与其结合可保持其松弛状态，以便能通过线粒体膜上