生物物理课1.ppt

2.2.3. 第三类和第四类膜蛋白都是膜整合蛋白(膜内在蛋白)，transmembrane protein, integral membrane protein. 膜整合蛋白含有较大的极性氨基酸序列位于胞外或胞浆侧，分别与膜脂的极性头部及细胞内外环境发生相互作用。这些胞外和胞浆结构域通过一条或几条跨过膜脂双分子层的疏水肽段（通常20－30氨基酸残基）相连接。其中含有一条跨膜序列的属于第三类膜蛋白，含有多条跨膜序列的属于第四类膜蛋白。 红细胞膜上的血型糖蛋白以及很多膜上的受体都属于第三类膜蛋白。 How freeze-fracture electron microscopy provides images of the hydrophobic interior of the cytoplasmic half of the bilayer (P face) and the external half of the bilayer (E face). Probable fates of band 3 and glycophorin molecules in the human red blood cell membrane during freeze-fracture. 一些通道蛋白或离子泵则属于第四类膜蛋白。这类蛋白中，一般含有几段疏水片段，可以多次跨膜， 如红细胞膜上的带3蛋白就是通过七条跨膜片段而形成的阴离子通道蛋白。细菌视紫红质是嗜盐细菌的紫膜上光驱动的质子泵，它也有七段跨膜区,膜内的跨膜序列均呈现?螺旋结构。 由于跨膜蛋白在膜中有确定的取向，它们呈现出一种功能的不对称性。这些蛋白只有用适当的去污剂才能从膜上溶解下来。 嗜盐菌(Halobacterium halobium living in saltwater pools where they exposed to a large amount of sunlight) 的质膜上存在膜片(patch), 称之为紫膜(purple membrane)。 紫膜是一种光能转换膜, 只含有一种蛋白：视紫红质(bacteriorhodopsin BR), 248 a.a., MW 26,000 BR 占紫膜总量的 75％。 BR利用光能驱使质子跨膜转移形成重要的电化学梯度，这种电化学梯度存储的能量用于合成ATP。 The structure of one BR molecule and its relationship to the lipid bilayer. all-trans-retinal* ?? 11-cis-retinal 2.2.4. 第五类膜蛋白发现的相对较晚，这类蛋白的膜外周结构域可以与特定的糖脂或脂肪酸形成共价连接，从而将蛋白抛锚在膜脂双分子层上。一些原生动物和哺乳动物质膜上的受体就属于这一类膜蛋白。 现在发现许多膜结合酶(membrane-bound enzyme)，像５－核酸酶、碱性磷酸酶、乙酰胆碱酯酶等，都是靠一个脂锚(lipid-anchor)连接在膜上的。它们不对称地分布上细胞膜上，催化位点在胞外。这些脂锚可能使蛋白在膜上具有较高的侧向移动能力，但确切的功能特征尚不清楚。 2.2.4.1. 肉豆蔻酸结合蛋白(myristoylated proteins) 蛋白质通过酰胺键(amide linkages)与肉豆蔻酸与(myristic acid, 14:0)结合。蛋白的N端必须是Gly, 并对与Gly相邻的氨基酸有高度选择,即必须是Asn, Gly, Val, 或Leu。这是由于肉豆蔻酸酰基转移酶(N-myristoyl acyl-transferase NMT)所要求的。 当核糖体合成多肽延伸30-40氨基酸时，氨基肽酶将其第一个(N端)氨基酸(Met)切去，暴露出第二个氨基酸(Gly), 一旦出现Gly, 由NMT作用使多肽链酰化。 由于NMT是ribosome complex 的一部分，故N-myristoylation是伴随蛋白质合成而形成，此过程又称为co-translational N-myristoylation. 2.2.4.2. 棕榈酸结合蛋白(palmitoylated proteins) 蛋白通过Cys的-SH与棕榈酸(16:0)形成thiolester. 由于棕榈酸转移酶位于Golgi内，故该过程又称为post-translational attachment of fatty acid. 2.1.1．磷脂 含有磷酸基团的脂类称为磷脂。它们是生物膜中最重要的脂类。 磷脂分