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海洋生物学实验操作手册
教育部顧問室海洋教育先導型計畫
課程名稱 :海洋生物學
海洋生物學實驗
操作手冊
國立高雄大學 生命科學系
分辨三種絨毛蟹
方法:
1.是否螯腳掌部內外表面均具絨毛,且額緣高低起伏,具明顯額齒………….
若是則進行步驟2
是否螯腳掌部內外表面不同時具絨毛,且額緣平直,不具明顯額齒……….
若是則進行步驟3
2. (1)若額緣上之額齒圓鈍而成波浪狀,第四前側齒退化,則為日本絨螯蟹
(2)若額緣上之內額齒尖銳且其間的缺刻最深,第四前側齒明顯,則為中華絨
螯蟹
3. (1)若螯腳掌部僅內表面具絨毛,第三顎腳狹窄,則為狹顎絨螯蟹
(2)若螯腳掌部僅外表面具絨毛,第三顎腳正常,則為台灣絨螯蟹
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序列分析(sequence analysis)
找尋基因(gene finding)
RNA二級結構預測(RNA secondary structures
prediction)
比較基因體學(comparative genomics)
蛋白質結構的預測 (protein structure prediction)
基因體 DNA的抽取
1. 取 30mg的組織塊,將其剪碎
2. 取 200μl LYS buffer 至 1.5ml eppendorf
3. 將剪碎的組織加到含有 LYS buffer的 eppendorf內
4. 把組織磨碎
5. 加 20μl Proteinase K
6. Vortex 20秒,混合均勻
7. 於 60℃作用 1 小時
8. 於 70℃作用 20 分鐘
9. 以70℃預熱 d.d. H O
2
10.加 200μl EX buffer 到組織液並 vortex混合均勻
11. 於 70℃作用 10 分鐘
12.加 210μl isopropanol, vortex混合均勻
13. 將 Mini Column置於 Collection tube 上
14. 將混合液吸至 Mini Column
15. 離心 8000 rpm ,2 分鐘
16. 去下清液
17.加 0.5ml WS buffer 至 Mini Column
18. 離心 8000 rpm ,2 分鐘
19. 去下清液
20.重複 17 、18 、19 步驟一次
21. 離心 12000 rpm ,2 分鐘
22. 將 column移至新的 1.5ml eppendorf
23. 加入 200μl預熱的 d.d H O .到 column內
2
24.靜置 1~5 分鐘
25. 離心 12000 rpm ,1 分鐘
26. 將萃取出來的 DNA保存在 -20℃
RE digest
1.取 RE 10×buffer 2μl 至 eppendorf
2.加 100×BSA 0.2μl
3.加 1μg DNA
4.加 d.d. H
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