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线性探针技术操作
结核分枝杆菌线性探针耐多药检测方法
操作
试剂准备
核酸DNA提取
多重PCR扩增
杂交检测
2
Hain LPA 检测流程
3
4) 结果判读
利福平和异烟肼
3) 杂交
扩增产物和 固化在
膜上的特异性探针杂交
DNA提取
2) PCR扩增
试剂准备
区域:试剂准备区
设备:移液器(10ul, 20ul, 200ul,1000ul),振荡器,离心机
耗材:1.5ml离心管、管架,PCR管、管架, Tip头,废液缸
试剂:PNM试剂,热启动Taq酶试剂盒,分子生物级H2O
4
试剂准备
扩增体系配制(50ul)
5
试剂准备
分装(45ul/样本)
6
如果 不能立即实验,-20度保存。
核酸DNA提取
区域:模板制备区
设备:生物安全柜、水浴锅、超声破碎仪、离心机、移液器(1000ul,200ul,10ul)
耗材:一次性吸管,50ml离心管、管架,1.5ml离心管、管架,Tip头,计时器,记号笔,接种环,废液缸
试剂:消化前处理液(4%NaOH,2.94%柠檬酸钠,NALC),无菌PBS,无菌蒸馏水
7
核酸DNA提取-痰
6%NaOH和2.94%枸橼酸钠等体积混合,配制1%NALC前处理液。
取2ml涂阳痰标本转移到50ml离心管,加1-2倍体积前处理液,振荡30s,静置15分钟。
加PBS到45ml,3000g离心20min。
倒掉上清,加2ml PBS混匀沉淀,分别取1ml转移到1.5ml离心管。
取1支管12000rpm离心5min,吸弃上清。
8
核酸DNA提取-痰
每管加150ul无菌蒸馏水。
95度水浴/金属浴20Min。
超声裂解15min。
12000rpm离心5min。
上清转移到1.5ml离心管。
如不能立即实验,标本-20度保存。
9
核酸DNA提取-菌株
每个培养阳性菌株取1平环菌株放入含300ul无菌蒸馏水的1.5ml离心管。
85度灭活20min(生物安全柜内)。
95度水浴15min。
超声破碎20min。
12000rpm离心10min,上清转移到另一1.5ml离心管,用于扩增。
如果不能立即实验,-20度保存。
10
PCR扩增
每个病例取5ul DNA样本到扩增混合液中
11
PCR扩增
痰标本和菌株用不同程序
12
培养标本
直接病人标本
15 min 95℃
1 个循环
1 个循环
30 sec95℃
10 个循环
10 个循环
2min58℃
25 sec 95℃
40 sec 53℃
20 个循环
30 个循环
40 sec 70℃
8 min 70℃
4℃ 24 h
1 个循环
1 个循环
扩增产物如果 不能及时杂交检测,短期4度保存。
杂交检测
区域:杂交区
设备:杂交仪,水浴锅,移液器(1000ul, 200ul, 20ul)
耗材: Tip头,废液缸,镊子,15ml离心管
试剂:Genotype 试剂盒,蒸馏水
13
杂交检测
化学变性
14
杂交检测
杂交(HYB和STR提前45度预热)
15
杂交检测
洗涤
16
杂交检测
耦合
17
杂交检测
洗涤3次
18
杂交检测
加底物显色液
19
杂交检测
洗涤
20
杂交检测
21
结果判读
CC:杂交对照
AC:扩增对照
TUB:鉴定结核分枝杆菌复合群
3个区域: rpoB, , katG 和inhA
27 条带:5个对照条带
22
结果判读
结核分枝杆菌复合群
TUB显色;未显色判为未检测到MTB
敏感
所有野生探针都显色且所有突变探针都未显色
耐药
任一野生探针未显色或任一突变探针显色
23
结果判读
24
25
操作图谱
26
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