第二节蛋白质分子的结构课件.pptVIP

三、肽的人工合成原理5（合成方法) 液相合成法：合成在溶液中进行，这种方法费力，目前不被采用。 固相合成法：采用固相支持物，反应在支持物上进行。常用的支持物如：苯乙烯与二乙烯基苯的共聚物，再经氯甲基化而成，简称氯甲基聚乙烯树脂。（利用树脂合成肽的流程见南大P100）。 多肽的合成1 多肽的合成2 四、蛋白质的三维构象1(目录） (一)研究构象的方法 (二)蛋白质分子的二级结构 (三)蛋白质的三级结构 (四)蛋白质分子的四级结构 四、蛋白质的三维构象2 (定义） 蛋白质分子的三维构象也称空间结构或高级结构。指的是蛋白质分子中原子基团在三维空间上的排列、分布及肽链的走向。 四、蛋白质的三维构象3 (示例1蛋白酶抑制剂） 四、蛋白质的三维构象3 (示例2虾红素） 四、蛋白质的三维构象3 (示例3木瓜及组织蛋白酶） 四、蛋白质的三维构象3 (示例4鸡半胱氨酸抑制剂） 四、蛋白质的三维构象3 (示例5） (一)研究构象的方法 1 其原理与光学显微镜或电子显微镜的原理基本相似，但光源波长很短。 λ=0.154nm，为一衍射波，得到一张衍射图。经数学方法重组，绘出电子密度图，从中构建出三维分子图象——分子结构模型。 1．X-射线衍射法： (一)研究构象的方法 2 2．重氢交换法和旋光色散法：测定蛋白质分子中α-螺旋体的含量。 3．核磁共振光谱法：测定蛋白质分子中哪个氨基酸残基发生构象变化。 4．园二色法：测定α-螺旋和β-折叠片的含量。 5．荧光、荧光偏振法等 （二）蛋白质分子的二级结构1 定义：蛋白质的二级结构是指蛋白质多肽链（一级结构）本身的折叠和盘绕的方式。 类型：天然蛋白质一般均含有α-螺旋、β-折叠和β-转角的结构。 （二）蛋白质分子的二级结构2 维持蛋白质分子构象的化学键1 （1）氢键：一个氢原子连接两个电负性强的原子（如氧、氮等）。其中一个为共价键，另一个即为氢键。在α-螺旋和β-折叠中占有极重要的地位，对蛋白质分子三维构象的维护也很重要。 （2）静电引力：正负带电基团之间的吸引力，如NH4+与COO-。静电引力较强，但对蛋白质分子三维构象的稳定贡献不是很大，有时也称为离子键或盐键。 （二）蛋白质分子的二级结构2 维持蛋白质分子构象的化学键2 （3）范德华力：是分子间的吸引力，是原子团相互接近时诱导产生的。它变化多样，对维持蛋白质活性中心的构象影响很大。 （4）疏水相互作用：是非极性基团为了避开水相而群集在一起的作用力。疏水作用是维持蛋白质高级结构的重要因素。 （二）蛋白质分子的二级结构2 维持蛋白质分子构象的化学键3 （5）二硫键（二硫桥）：两个硫原子之间形成的共价键。此键作用很强，可把不同肽链或同一条肽链的不同部分连在一起，对稳定蛋白质构象起重要作用。大多数蛋白质分子由于二硫键的断裂其生物学活性随即丧失。 维持蛋白质构象的化学键主要是次级键（氢键、离子键、疏水作用和范德华力）。这些次级键是非共价键。 肽键、二硫键、酯键等被称之为共价键。 （二）蛋白质分子的二级结构2 二级结构的类型1 （1）?-螺旋 最常见的二级结构形式。 （二）蛋白质分子的二级结构2 二级结构的类型1 （1）?-螺旋特点1 ①每隔3.6个氨基酸残基，螺旋上升一圈。上升一圈相当于向上平移0.54nm，即每个氨基酸残基上升0.15nm，每个残基沿轴旋转1000。 （二）蛋白质分子的二级结构2 二级结构的类型1 （1）?-螺旋特点2 ②氨基酸残基侧链伸向外侧，相邻螺圈之间形成链内氢键。 氢键是由每个氨基酸残基的N-H与前面隔三个氨基酸残基的C=0形成的。 （二）蛋白质分子的二级结构2 二级结构的类型1 （1）?-螺旋特点3 ③一般为右手螺旋。 （二）蛋白质分子的二级结构2 二级结构的类型1 （1）?-螺旋特点4 ④链中如有脯氨酸，则螺旋被中断，产生一个“结节”，这是因为脯氨酸的亚氨基上的氢参与肽键形成后没有多余的氢原子形成氢键，这样肽链拐弯不再形成α-螺旋。 脯氨酸 （二）蛋白质分子的二级结构2 二级结构的类型1 （1）?-螺旋特点5 ⑤另外，甘氨酸由于没有侧链的约束，难以形成α-螺旋所需的二面角。 其次，如肽链中连续存在带相同电荷的氨基酸，由于同性电荷相斥也会影响α-螺旋不稳定。 甘氨酸 * * 第二节 蛋白质分子的结构 二、蛋白质一级结构的研究方法 三、肽的人工合成原理 一、蛋白质分子的一级结构 四、蛋白质的三维构象 一、蛋白质分子的一级结构1 ☆一级结构是氨基酸按一定的排列顺序构成的蛋白质肽链骨架。 ☆多肽链的氨基酸顺序。 ☆多肽链内或链间二硫键的数目和位 置。 最重要的是多肽链的氨基酸顺序，它是蛋白质生物功能的基础。 蛋白质是由数条多