土壤氮循环功能生物基因高通量检测方案.pdfVIP

土壤氮循环功能生物基因高通量检测方案.pdf

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氮循环功能基因高通量检测资料 微基生物科技(上海)有限公司 微基生物科技(上海)有限公司 氮的作用及氮循环的过程 氮是生命体核酸与蛋白质必不可少的组成元素。氮 素的生物地球 化学循环(氮循环)对生命的存在和持续 有关键作用,本质上是微 生物驱动的氮素转化、利 用及循环的过程 微基生物科技(上海)有限公司 固氮作用--固氮微生物 将空气中的游离氮转化为化合态氮的过程,称为固氮(nitrogen fixation) 1. 人工固氮 2. 天然固氮(又称高能固氮) 3. 生物固氮 生物固氮是指固氮微生物将大气中的氮还原成氨的过程。 作用过程 固氮酶基因 + N2 NH4 Nif 常研究的基因 固氮酶(nif)多样性研究主要基于nifH 基因的系统进化分析, 这主要由于nifD、nifK 基因序列相对较少, 可能大大限制了系统进化比较分析的范围。 微基生物科技(上海)有限公司 硝化作用--硝化菌 作用过程 是氮循环的核心环节 氧化 氧化 NH4+ 亚硝酸(盐) 硝酸(盐) 氨氧化菌AOB 亚硝酸盐氧化菌NOB 氨氧化菌包括氨氧化细菌AOB 和氨氧化古菌AOA 研究基因 1 16S rRNA 基因 2 功能基因: 氨氧化的功能基因氨单加氧酶α亚基基 因( amoA ) 氮氧化中的关键酶亚硝酸盐氧化还原酶(NXR) 的编码基因nxrA 微基生物科技(上海)有限公司 反硝化作用--反硝化菌 随着现代研究的不断发展,更多的反硝化微生物从土壤、沉积物、水环境中分离得到。 由于反硝化微生物是一大类生物类群,现已被发现广泛存在于细菌、真菌及古菌中, 因此传统经典的16S rDNA 方法就不适合反硝化菌的生态学研究。因此,一些功能基 因,如反硝化酶编码基因常被选作分子探针和引物设计的模板用于多种生态环境下微 生物体系与种群结构的分析。 反硝化菌主要为原核生物,大量存在于在α-, β- 和γ-变形菌纲中。 作用 过程 硝酸盐还原酶 亚硝酸盐还原酶 氧化还原酶 氧化亚氮还原酶 NO3- NO2- NO N2O N2 Nar Nir Nor Nos 常研究的基因 narG、nirK/nirS、norB、nosZ 微基生物科技(上海)有限公司 氨化作用 氨化作用(ammonification )又叫脱氨作用,微生物分解有机 氮化物产生 氨的过程。 脱氮作用:是指土壤中的硝酸盐再缺乏氧气或是土壤算话时, 被某些真菌或是细菌转化为氮、一氧化氮等气体形式释放至大气中的 作用,故土壤缺氧常导致植物缺失氮肥。 作用过程 有机氮化物 NH4+ 微基生物科技(上海)有限公司 微生物参与氮循环的过程 微基生物科技(上海)有限公司 相关基因汇总 微基生物科技(上海)有限

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