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一、基因概念的发展 染色体上的DNA与基因的关系:摩尔根的果蝇遗传试验证明基因定位在染色体上。 基因与顺反子(cistron)的关系: 拟等位基因(pseudoallele):表型效应类似紧密连锁的功能性等位基因,但不是结构性的等位基因,其发现证明:基因是可分的。 真核生物染色体上DNA序列的类型 根据DNA复性动力学的研究,真核生物染色体上的DNA序列可以分为四种类型: (1)单一序列(非重复序列) 在一个基因组中只有一个拷贝。 原核生物的基因大都是不重复序列,而真核生物的大多数的结构基因在单倍体中都是单拷贝的。 单拷贝基因通过基因扩增等放大作用仍可以获得大量的蛋白质。 (2)轻度重复序列 在一个基因组内有2-10个拷贝。在某些情况下,这些序列并非一点不差地重复,这些基因的产物在氨基酸组成上略有差异。 例如胚胎、胎儿和成人的血红蛋白β链的一系列基因就是如此。 (3)中度重复序列 在基因组中一般有10~几百个拷贝。中度重复序列一般是不编码的序列。一般认为在基因的调控中起重要的作用,包括开启或关闭基因的活性,DNA复制的起始、促进或终止转录以及转录产物的处理等。 最典型的例子就是Alu序列家族。Alu家族序列成员众多,约有300,000个,广泛散布于非重复序列之间。 (4)高度重复序列(卫星DNA序列) 这类DNA序列只在真核生物中发现,占基因组的10%~60%。由6~100个碱基组成,在DNA链上串联重复几百万次。 卫星DNA大多位于染色体的着丝粒部分,是异染色质的组成部分。 卫星DNA是不转录的,可能与染色体的稳定性有关。 Kaine(1983)和Chu(1984)相继在原核生物中发现了内含子,特别是Chu对于大肠杆菌噬菌体T4胸腺嘧啶核苷酸合成酶基因中核苷酸内含子的研究,颠覆了内含子是真核生物“真质标记”之说。 断裂基因广泛存在于各种不同的生物中。 如果一个基因有几个内含子,一般总是把基因的外显子分割成n+1部分。内含子的长度可比外显子长许多倍。 真核生物中有些基因也是没有内含子的。如组蛋白的基因、干扰素的基因等。它们大多以基因簇的形式出现。 大多数编码酵母蛋白质的基因也没有内含子。 真细菌的基因组内不存在内含子。 5. 细胞器基因与基因组 真核生物细胞器中有两类细胞器能携带遗传物质,即线粒体和叶绿体。 线粒体和叶绿体DNA可编码自身所需的部分蛋白质及tRNA和rRNA。 细胞器基因组只编码其中的一部分蛋白质,其余所需的蛋白质和酶均由核基因编码。 但线粒体和叶绿体基因表达所需要的RNA均由自身提供。 线粒体有自己的蛋白质合成体系,其中rRNA和tRNA均由线粒体自身编码合成。但其RNA聚合酶、氨酰-tRNA合成酶和核糖体蛋白均由核基因编码。 线粒体其他蛋白质的合成也常常由核基因组和线粒体基因组共同参与。 每个细胞中有几百个线粒体。每个线粒体有多个DNA 拷贝。 结构基因(Structural gene)是指基因组中与成熟mRNA 5’和3’端之间相对应的区域。转录从mRNA的5’端起始延伸到3’端,经RNA剪接产生。 基因的范围可以扩大到包括基因两端激活或终止基因表达的调节区域。 真核基因并不一定都是割裂的,有些用原核基因中同样的方式与蛋白质产物直接对应。 在酵母中,大多数基因是连续基因。 高等真核基因大多是割裂基因,并且内含子比外显子长,使基因比其编码区域长得多。 大多数高等原核基因是割裂的,但是内含子在数量和大小上变化非常大。核基因的内含子一般在读码框上有终止密码子,因而无编码功能。 所有类型的基因都可能是割裂基因,包括编码蛋白质的核基因,编码rRNA的核基因,以及编码tRNA的基因。 在低等真核生物中,线粒体也存在割裂基因。 割裂基因在细菌和细菌噬菌体中也已发现,尽管在原核基因组中是很少见。 有些割裂基因只有一个或少数几个内含子。珠蛋白基因便是很好的例子。 2. 外显子序列保守,内含子序列多变 一般而言,当两个基因是相关的,它们外显子的关系比内含子的关系更紧密。在特殊情况下,两个基因的外显子可能编码同一个蛋白质,但其内含子可能不同。 说明这两个基因可能起源于一个共同的祖先基因,拷贝间内含子差异积累,但因编码蛋白质功能的需要,其外显子区域是保守。 外显子可能是基因进化的基石,它们可以通过不同的方式进行组合。 一个基因可能含有几个与其他基因相关的外显子,但也存在一些并不相关的外显子。一般而言,此时其内含子也不相关。这些基因可能是由同一些外显子经复制和转移产生的。 割裂基因的进化模型 割裂基因是如何进化而来的? 现在割裂基因的原始形式是怎样的呢? 目前有两种模型。 “内含子占先(Int
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