03.人类基因组与遗传多态.ppt

人类基因组与遗传多态 四川大学华西医院医学遗传室 孙 岩 主讲 目的要求 掌握基因、人类基因组的概念 熟悉人类基因组组成、结构 熟悉基因结构与有关概念 掌握遗传多态性的概念、分类及检出方法 了解遗传多态性的医学意义 review 基因结构示意图 一、 人 类 基 因 组 基因组 一个物种的单倍体的染色体的数目 携带有细胞或生物机体的一整套遗传指令的核酸总量 人类基因组 人类单倍体细胞中的染色体数目 包含人类的一整套遗传指令的全部DNA 人类基因组的结构 细胞核内基因组 24 Chromosomes 3.2 X 109 bp 30,000-40,000 genes 线粒体基因组 Double-stranded circlar DNA 16,569 bp 37 genes 细胞核内基因组的构成 单拷贝序列 核苷酸序列只出现一次或几次 轻度重复序列 2-10个拷贝（2-3copies常被看作单拷贝） 中度重复序列 10-几千个拷贝 高度重复序列 常达106拷贝以上 单拷贝序列/轻度重复序列 单拷贝序列 占基因组的60~65% 一般只有单个或几个拷贝 包含大多数编码蛋白质的基因 轻度重复序列 2-3copies常被看作单拷贝 包含有一些基因家族和基因簇 定 义 基因家族 真核基因组中的许多来源相同、结构相似、功能相关的基因 基因家族的成员可以分布在不同的染色体上，也可以集中在同一条染色体上 比如，微管蛋白基因家族中的MAP2~2q34;MAPT1~17q21;MAPT2~6p21 基因簇 在染色体上集中成簇的一组基因 人类的类α和β珠蛋白基因簇分别集群排列于16p13和11p15 中度重复顺序 重复单元长度300~7000bp 一般是不编码的序列 Alu family\KpnI family 小卫星DNA (15-65bp) 微卫星DNA (1-6bp) 参与基因表达调控 开启或关闭基因 DNA复制的起始 促进或终止转录 Pre-mRNA的加工 分散的重复序列 短分散核元件 ( SINE) 长度 300-500bp， 可达75万拷贝 Alu家族： 300 bp, 300,000 个成员，170 位有AluI 的切点 （AG CT）， 基因组中散在分布，位于基因的非编码区，可能与基因表达调控有关 长分散核元件（LINE） 长度5000-7000bp，20万-50万拷贝 LINE1元件（KpnI家族）：6000kb，编码逆转录酶，基因组中每隔50kb就有一个LINE1重复。 高度重复顺序 重复单元长度：几个到几百个bp 拷贝数：106 着丝粒、端粒等处的卫星DNA rRNA和某些tRNA基因 不转录，参与染色体结构维持，形成结构基因间隔，可能与减数分裂时同源染色体联会配对有关 卫星DNA 在基因组的某些特定部位，由许多短的高度重复 的序列串联而成，在密度梯度离心（或复性试验）时被分离出来 线 粒 体 基 因 组 1960年以前，普遍认为DNA只存在于核。 1963年，M.Nass和S.Nass发现线粒体中含有DNA 。他们观察到mt其中一种纤维经DNase处理后，纤维结构消失，以后又在许多动植物细胞线粒体中分离出DNA 。 1966年，Slonimski等分析了酵母野生型mtDNA与呼吸缺陷型酵母mtDNA ，揭示了线粒体的变化和线粒体结构与功能变化的相关性，首次证明了线粒体具有遗传功能。 1981年，英国B.G.Barrell等发表了人mtDNA全长测序的结果。是分子水平上初步清楚基因结构的第一个真核细胞染色体以外的完整的细胞器遗传单位，全长16,596bp。 线粒体基因组的构成 Double-stranded, circular DNA、16,569 bp Copies 2 to 10 in each mitochondria ( 1,000 in each cell ) Strands Heavy (H) strand: Rich in guanines; 28 genes Light (L) strand: Rich in cytosines; 9 genes mtDNA encodes for 37 genes Encodes 13 of mitochondrial peptide subunits All 13 peptides are in mitochondrial respiratory-chain complex (OXPHOS) Remaining 67 OXPHO