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1.蛋白质是生物体内必不可少的重要成分 氮占生物组织中所有含氮物质的绝大部分。因此,可以将生物组织的含氮量近似地看作蛋白质的含氮量。由于大多数蛋白质的含氮量接近于16%,所以,可以根据生物样品中的含氮量来计算蛋白质的大概含量 第二节 氨基酸化学 一、氨基酸的结构与分类 3.构成蛋白质的20种氨基酸 二.氨基酸的重要理化性质 1.一般物理性质 2.氨基酸的离解性质 氨基酸在结晶形态或在水溶液中,并不是以游离的羧基或氨基形式存在,而是离解成两性离子。在两性离子中,氨基是以质子化(-NH3+)形式存在,羧基是以离解状态(-COO-)存在。 在不同的pH条件下,两性离子的状态也随之发生变化。 3.氨基酸的等电点 应用:氨基酸定量分析—甲醛滴定法(间接滴定) (3) 与2,4-二硝基氟苯(DNFB)反应 应用:鉴定多肽或蛋白质的N-末端氨基酸 ★首先由Sanger应用,确定了胰岛素的一级结构 A. B.水解DNP-肽,得DNP-N端氨基酸及其他游离氨基酸 C.分离DNP-氨基酸 D. 由Edman于1950年首先提出 为α- NH2的反应 用于N末端分析,又称Edman降解法 层析法鉴定 Edman降解法的改进方法--- DNS-Edman降解法 用DNS(二甲基萘磺酰氯)测定N端氨基酸 原理DNFB法相同 但水解后的DNS-氨基酸不需分离,可直接用电泳或层析法鉴定 由于DNS有强烈荧光,灵敏度比DNFB法高100倍,比Edman法高几到十几倍 可用于微量氨基酸的定量 用Edman降解法提供逐次减少一个残基的肽链 灵敏度提高,能连续测定。 多肽顺序自动分析仪 样品最低用量可在5pmol 在多肽链中,氨基酸残基按一定的顺序排列,这种排列顺序称为氨基酸顺序。 通常在多肽链的一端含有一个游离的?-氨基,称为氨基端或N-端;在另一端含有一个游离的?-羧基,称为羧基端或C-端。 氨基酸的顺序是从N-端的氨基酸残基开始,以C-端氨基酸残基为终点的排列顺序。如上述五肽可表示为: Ser-Val-Tyr-Asp-Gln 2.天然存在的重要多肽 二.蛋白质的一级结构 第六节????? 蛋白质的分离纯化 一、蛋白质分离纯化基本方法 1、按溶解度不同分离 2、按所带电荷不同分离 3、按分子量大小不同分离 二、蛋白质纯度的鉴定 溶解度曲线法:一个拐点; 电泳纯 2.超二级结构和结构域 (1)超二级结构 在蛋白质分子中,由若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成有规则的、在空间上能辨认的二级结构组合体。几种类型的超二级结构:α α;ββ;βαβ;βββ. ★超二级结构在结构层次上高于二级结构,但没有聚集成具有功能的结构域. α α ββ βαβ (2)结构域 对于较大的蛋白质分子或亚基,多肽链往往由两个或两个以上相对独立的三维实体缔合而成三级结构。这种相对独立的三维实体就称结构域。 结构域通常是几个超二级结构的组合,对于较小的蛋白质分子,结构域与三级结构等同,即这些蛋白为单结构域。 结构域一般由100~200 个氨基酸残基组成,但大小范围可达 40~400 个残基。氨基酸可以是连续的,也可以是不连续的. 结构域之间常形成裂隙,比较松散,往往是蛋白质优先被水解的部位。酶的活性中心往往位于两个结构域的界面上。 结构域之间由“铰链区”相连,使分子构象有一定的柔性,通过结构域之间的相对运动,使蛋白质分子实现一定的生物功能。 在蛋白质分子内,结构域可作为结构单位进行相对独立的运动,水解出来后仍能维持稳定的结构,甚至保留某些生物活性。 3.蛋白质的三级结构 蛋白质的三级结构是指多肽链在二级结构的基础上进一步盘旋、折叠,从而生成特定的空间结构。包括主链和侧链的所有原子的空间排布,一般非极性侧链埋在分子内部,形成疏水核,极性侧链在分子表面。 4.蛋白质的四级结构 许多蛋白质是由两个或两个以上独立的三级结构通过非共价键结合成的多聚体,称为寡聚蛋白。寡聚蛋白中的每个独立三级结构单元称为亚基。蛋白质的四级结构是指亚基的种类、数量以及各个亚基在寡聚蛋白质中的空间排布和亚基间的相互作用。如,血红蛋白的四级结构得测定由佩
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