物种多样性信息系统的研究与初步建立-国际生物多样性计划.PDFVIP

第15 章 物种多样性信息系统的研究与初步建立 物种多样性在生物多样性中具有极其重要的地位 它既是遗传多样性的载体 又是生态多 样性的基础 据估计全球物种数目在200 万至1 亿 但只有 140 万种被定名 造成认识不统一 的一个重要原因就是缺乏中心数据库 计算机技术的发展和物种多样性信息系统的不断完善正 改变着这种现象 我国在生物数据库建设方面起步较晚 虽然有的单位于20 世纪80 年代利用 微机建起一些局部应用的数据库系统 但全面考虑建立信息系统还是在90 年代生物多样性项目 开始之后 本章分析了物种数据库与标本馆管理系统设计的思想 实施原则 并以物种数据库 和鸟类标本数据库为例 讨论了具体建立的方法 介绍了生物多样性信息系统可能使用的几项 计算机新技术 以及建立过程中遇到的一些实际问题和解决方法 15 1 物种多样性信息系统在生物多样性信息系统中的位置与组成 目前 国际上与生物多样性有关的信息系统多数集中在物种方面 例如 TROPICOS Mis scurf Botanlcal Garden MUSE Dr Julian Humphries 设计 国际植物园保护协会 Botanic Gardens Conservation International 简称BGCI 的濒危植物材料数据库 以及台湾师 范大学的两栖爬行数据库 海洋科技博物馆的台湾鱼类数据库等 物种多样性信息系统是生物多样性信息系统最重要的组成部分之一 它与生态多样性和遗 传多样性信息系统相连 同时又与几个公用的系统相连 图15 1 这里不包括广义的涉及人 文科学部分 文化多样性的生物多样性 生物多样性信息系统中使用的信息不仅仅是其自身 的数据 还用到自然和行政区划 地理 气象 土壤 环境污染 人类活动等信息 虽然这些 数据在生态信息系统中使用的程度高于物种与遗传多样性信息系统 但后者也仍会用到它们 所以 行政区划方面数据的标准化也是必要的 目前中国科学院各有关研究所正相互配合完成 此任务 本章作者 夏经世 伍玉明 物种多样性信息系统包括物种数据库 标本数据库及管理系统 濒危物中数据库 经济物 咱数据等 以及使用的地理行政区划代码数据库 地理区划代码数据库 多媒体数据库等 图 书馆 15 2 物种多样性信息系统的建立 生物多样性信息系统 物种多样性信息系统的设计方法与其他软件设计步骤相同 包括需 求分析 总体设计 模块设计 试运转 调试等等 其中的模块设计和数据的整理录入是 硬 件 易为人们理解 而需求分析 总体设计则比较 软 如不重视这两个步骤则往往事倍功半 严格地讲 一个关系数据库 relationa database 中包括一个以上的表 DBASE III 中的 每一个 dbf 文件只相当于一张二维表 table 通常我们建立的一组相关的 dbf 文件 一 个或一组 prg 文件 包含各种查询表单 打印输出 等组成一个完整的数据库 Database 数据库中field 我们译作域或字段 本文中的数据库是严格意义上的数据库 即一个数据库含 一至多个table 表 form 表单 query 查询 report 报告 view 视图 等 物种多样性信息系统以数据库管理系统为主 附以其他模块构成 因此采用什么数据库系 统比较好是一个关键 我们认为 如果使用C 语言或汇编语言编写的专用系统 虽然系统运行 的速度较快 但为以后的维护 升级和平台转移带来困难 采用微机上的xBASE 或支持xBASE 的系统更好 即使使用单用户的DOS 和dBASE III也很容易转移到多用户的Windows 操作系统 和相应的数据库系统上 15 2 1 三中国动物分类代码的制定 在物种数据库中首先遇到的是物种代码如何制定的问题 物种代码应是唯一的 不因其他 因素变化而改变 例如分类学中属地位变更时它不应改变 另外 物种代码并不是为了分类学 者理解 调用的 它仅仅是数据库中关键词 key word 所必需的 是为计算机使用的 因此 应尽量减少冗余 提高效率 同时 物种代码必须含有一定的分类学意义 以便数据库建设者 和系统管理员理解 调用和调试 国外物种代码的编制早在70 年代就已开始 编制方法 遵循规则各不相同 例如 D