蛋白质结构(dl).ppt

（四）超二级结构和结构域 近年来在研究蛋白质构象、功能和进化的变化时，发现在蛋白质二级结构和三级结构之间存在着两个过渡层次，即超二级结构和结构域。 1、超二级结构 多肽链内若干顺序上相邻的二级结构的构象单元在空间折叠中靠近，彼此相互作用，形成有规则的，在空间上能辨认的二级结构的组合体。 超二级结构在结构层次上高于二级结构，但不具有功能。超二级结构的形式主要有：?-螺旋组合（ ? ? ）； ?-折叠组合（ ? ? ）；?-螺旋?-折叠组合（ ? ? ? ）；；希腊钥匙结构 2、结构域 多肽链在超二级结构的基础上进一步的盘绕折叠成紧密的近似球状的结构，在空中彼此分隔，相互独立，结构域之间通过共价的、松散的肽链相连（铰链区）。 对于有些较小的蛋白质分子，结构域和-三级结构是一个意思，即这些蛋白质分子是单结构域的。 2、稳定三级结构的作用力 氢键 疏水力（疏水作用力） 范氏引力（分子间的作用力） 离子键（盐键） 酯键 二硫键 3、球蛋白分子结构的一般特征 一条肽链往往是通过一部分а-螺旋，一部分?-折叠，拐角处形成?-转角或无轨卷曲盘绕折叠成致密的—球形分子 具有极性侧链的氨基酸残基几乎分布在分子的表面—亲水的表面 而非极性氨基酸侧链的残基包埋在分子的内部形成—疏水的核 分子表面往往有一个裂隙（口袋；凹槽），常常是疏水的环境。这一部位常常是球蛋白的—活性部位 （六）蛋白质的四级结构 2、蛋白质的四级结构 寡聚蛋白质中亚基的空间排布、相互关系和相互作用力，称之为蛋白质的四级结构。 亚基的种类和数量 均一四级结构 不均一四级结构 亚基的空间排布 亚基间的相互作用力 次级键 3、血红蛋白的四级结构 Hb分子量为 65000 d Hb是由2条а链和2条?链组成的四聚体。 а链由141个氨基酸组成，?链由146个氨基酸组成，各自都有一定的氨基酸排列顺序。 两种亚基的一级结构差别较大，但它们的二、三级结构却大致相同，而且与肌红蛋白极为相似。 五、蛋白质结构与功能的关系 蛋白质分子具有多种多样的生物功能是以其极其复杂的结构为基础的。这不仅需要一定的化学结构，更重要的是需要特定的空间结构作基础。研究蛋白质结构与功能之间的关系是分子生物学的一个重要方面。 （一）一级结构与功能的关系 1、分子病 分子病（molecular disease)：是一种遗传性疾病，由于DNA分子上基因突变，而合成了失去正常生物活性的异常蛋白质，或者是缺失某种蛋白质，从而影响了机体正常的生理功能而产生的疾病。 研究表明几乎所有遗传病都与pr分子结构改变有关。 2、种属差异与分子进化 同源蛋白质：不同种属中完成相同功能的蛋白质。 对于不同种属来源的同种pr进行一级结构测定和比较，发现存在种属差异。这种差异可能是分子进化的结果。 比较种属来源不同而功能相同的同源pr的一级结构，发现与活性和pr空间结构密切相关的aa残基高度保守。 一级结构是空间构象的基础 蛋白质的空间构象归根到底是由一级结构决定 一级结构与功能的关系是十分重要的 一级结构与功能的关系实际上反映的也是高级结构与功能的关系 五、蛋白质的性质 两性解离 高分子量性质 胶体溶液性质 蛋白质的沉淀 蛋白质的变性和复性 蛋白质电泳： 该方法的优点：计算所得的真实分子量十分精确。缺点：必须和其它方法结合使用，否则不能提供真实分子量。 S ——沉降系数(sedimentation coefficient, S) ，代表大分子物质在超速离心时单位离心力场的沉降速度，与蛋白质的大小和形状有关。其数值定为1×10-13秒，分子越大，沉降越快，其S值就越大。 沉降速度法优点：操作时间短，还可以鉴定纯度（均一的蛋白质溶液仅形成一个界面，而不同分子量的混合物形成几个界面）． 缺点：需要参数多 应用举例 临床医学上，变性因素常被应用来消毒及灭菌。 此外, 防止蛋白质变性也是有效保存蛋白质制剂（如疫苗等）的必要条件。 （七）蛋白质的分类 . 一种分子量为24，000，PI 5.5的蛋白质的酶被一种分子量类似，但PI为7.0的蛋白质和另外一种分子量100,000、PI 5.4的蛋白质污染。提出一种纯化该酶的方案。 （三）蛋白质的溶液是胶体溶液 1、胶体溶液：以固体物质做分散相，液体做分散剂的分散系。 粗分散系： 100nm ，不稳定。 胶 体：100nm 分散颗粒 1nm，相对稳定。 真溶液：分散颗粒 1nm，稳定。 分散系是一种物质以或大或小的颗粒分散到另一种物质中去所得到的体系，它包括分散相和分散剂。