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吉林农大动物生化第4章 节 核酸化学 .ppt
第 四章 核酸化学;一、核 酸(nucleic acid)的含义 ;二、核酸的发现及研究进展 ;三、核酸的分类;四、核酸的分布 ;五、主要生物学功能;第二节 核酸的化学组成
Chemical Component and of Nucleic Acid;一、 元素组成;戊糖;1、嘌呤(purine) ;修饰嘌呤(稀有嘌呤);修饰嘌呤(稀有嘌呤);2、嘧啶(pyrimidine);稀有嘧啶;尿嘧啶(uracil, U);腺嘌呤;(二)戊 糖;修饰糖;核糖核苷(核苷):A、G、U、 C
脱氧核糖核苷(脱氧核苷):dA、dG、dT、dC;;;胸苷(dT);β1’;核糖核苷酸(NMP):AMP, GMP, UMP, CMP
脱氧核苷酸(dNMP):dAMP, dGMP, dTMP, dCMP ;3、结构;一磷酸核苷(NMP);一磷酸脱氧核苷
(dNMP);4、体内重要的游离核苷酸及其衍生物;环核苷酸的分子结构;;;第三节 核酸的分子结构
Dimensional Structure of Nucleic Acid;5′端;;二、核酸的一级结构;(二) DNA的一级结构;DNA来源 ;三、二级结构;(1)DNA双螺旋(B型)结构;③所有的碱基平面几乎与螺旋轴垂直。所有的糖环平
面与螺旋轴平行。相邻两个碱基平面间的距离为0.34nm,夹角为36℃ ,所以每10对碱基对旋转一周,螺距为3.4nm。;碱基互补配对 ;;;;B—DNA :相对湿度92%;1979年,Rice发现人工合成的CGCGCG
序列为左手双螺旋,且磷酸二酯键呈
锯齿状(Zigzag),故称Z型DNA。 ;(二)RNA;tRNA:三叶草结构;rRNA:;四、三级结构;绝大多数原核生物的DNA
都是共价封闭的环状双
螺旋。如果再进一步盘
绕则形成麻花状的超螺
旋三级结构。 ;3、DNA在真核生物细胞核内的组装;;;第四节 RNA的分子结构;一、RNA的碱基组成
RNA由四种主要碱基A、G、C、U组成。
一般不含T。还含有少量稀有碱基。如假尿嘧
啶核苷及甲基化碱基等。但RNA分子中的碱基
没有A=U、G=C的比例关系。;RNA又可根据分子大小和生物学功能不同,分为:;;RNA的种类、分布、功能;RNA分子主要由AMP,GMP,CMP,UMP四种
核糖核苷酸组成。RNA的一级结构就是指
RNA分子中核糖核苷酸的排列顺序及连接
方式。
;1、真核生物 mRNA一级结构特点;帽子结构;2、tRNA的一级结构特点
含 10~20% 稀有碱基,如 DHU
3′末端为 — CCA-OH
5′末端大多数为G
具有 T?C ;N,N二甲基鸟嘌呤;三、RNA的二级结构;* tRNA的二级结构
——三叶草形
氨基??臂
DHU环
反密码环
额外环
TΨC环;氨基酸臂;;;一、核酸的一般理化性质
1、大分子性质:核酸的分子量很大,一般为106~1010。核酸溶液粘度大。
2、溶解性:核酸微溶于水,不溶于有机溶剂。
3、核酸的酸碱性质
核酸中的磷酸和碱基均能发生两性解离。核酸是两性电解质。具有酸性。
DNA等电点 4—4.5;RNA 等电点 2—2.5; 二、颜色反应 ;二、? 核酸的紫外吸收
碱基、核苷、核苷酸和核酸在240~290nm的紫外波段有强烈的光吸收,最大吸收峰为260nm。
λmax=260nm;1. DNA或RNA的定量
OD260=1.0相当于 50μg/ml双链DNA
40μg/ml单链DNA(或RNA)
20μg/ml寡核苷酸
2.判断核酸样品的纯度
DNA纯品: OD260/OD280 = 1.8 RNA纯品: OD260/OD280 = 2.0若溶液中含有杂蛋白或苯酚,则A260/A280比值明显降低。
3、判断DNA是否变性
在DNA的变性过程中,摩尔吸光系数增大(增色效应)
在DNA的复性过程中,摩尔吸光系数减小(减色效应;(一) 变性(denaturation);;▲ 实质 破坏DNA的空间结构
;例:变性引起紫外吸收值的改变;DNA的热变性; Tm:变性是在一个相当窄的温度范围内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度,又称融解温度(melting temperature, Tm)。其大小与G+C含量成正比。;影响DNA的Tm值的因素;②G-C含量与Tm值成正比。
测定Tm,可推知G-C含量。
G-C%=(Tm-69.3)×2.44;③介质中离子强度
离子强度高,Tm高。;?★变性因素 :
热变性
酸碱变性(pH小于4或大于11)
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