生物信息学 (生物信息学及其在医学中的应用)知识介绍.ppt

; Durbin等, Biological sequence analysis（英文原版）, 清华大学出版社，2002 Mount，Bioinformatics—Sequence and Genome Analysis，科学出版社，2002年（中文版由钟杨等译、高等教育出版社2003年出版） 生物信息学相关期刊 ;课程目标;课程内容;生物信息学;曼哈顿原子弹计划;1984.12 犹他州阿尔塔组织会议，初步研讨测定人类整个基 因组DNA序列的意义 1985 Dulbecco在《Science》撰文 “肿瘤研究的转折点:人 类基因组的测序” ;人类基因组计划 (HGP，Human Genome Project) 目标：整体上破解人类遗传信息的奥秘;人类基因组计划-DNA 测序技术;人类基因组序列的组装;人类基因组序列的组装和注释;基因的鉴定;基因的鉴定-隐马尔可夫模型;基因的鉴定;人类基因组序列的显示;HGC;基因组学研究;生物学的挑战;Encyclopedia of DNA Elements （ENCODE） 计划;DNA元件百科全书计划 (ENCODE) 目标：对人类基因组功能元件进行全面的鉴定和分析 ;ENCODE 计划研究规划;目标：对人类基因组1%的序列功能元件进行全面的鉴定和分析 ;高通量技术-芯片技术;高通量技术-芯片数据分析;ENCODE试点研究计划-比较基因组学;ENCODE试点研究计划-转录组;ENCODE试点研究计划-转录组注释;ENCODE试点研究计划-转录调控;ENCODE试点研究计划-非编码RNA;ENCODE试点研究计划-非编码RNA;ModENCODE Project;28篇相关的文章 ;1000 Human Genomes Project ;千人基因组计划的目标;为什么需要新一代高通量测序技术;新一代高通量测序技术;新一代高通量测序技术;高通量测序技术带来的挑战和机遇;高通量测序技术-存储;高通量测序技术-比对;高通量测序技术-可视化比对数据;rnaNGS: discovering small and long ncRNAs from pooled NGS data; deepView 可视化浏览千人基因组计划数据;deepView 各式各样的功能;课程小结;生物信息学的应用;生物信息学的研究意义;时刻铭记 实验永远起着决定作用 计算/理论生物学的发展离不开实验生物学的贡献 实验生物学日益依赖计算/理论生物学的指导 重视基础研究，原创！;目标：开发计算机的算法解决生物学的问题 ;Perl 变量定义和声明;Perl 语句;Perl 基本语法-模式匹配;Perl 基本语法-模式匹配;Perl 基本语法-函数;Perl 基本语法-???据结构;Perl 编程实践例子;Thank You！