the fourth chapter nucleic acid chemistry 核酸化学 分子生物学教材.pptVIP

The rules of the Nobel Prize forbid posthumous nominations, [87]; because Rosalind Franklin had died in 1958 she was not eligible for nomination to the Nobel Prize subsequently awarded to Crick, Watson, and Wilkins in 1962 T2噬菌体 SARS 酮式碱基和烯醇式碱基可以转化， 二者在生物体内处于平衡状态； 嘌呤碱和嘧啶碱较稳定， 不被稀酸和稀碱破坏 红色：氧o 绿色：碳c 蓝色：氮n 白色：氢h Pentose 戊糖 核苷酸中的磷酸能发生解离。在单核苷酸中磷酸有二个解离基，在多聚核苷酸中只有一个。由于核苷酸中含有碱基和磷酸基，因此它们在一定的pH条件下可行成两性离子。它的等电点由第一磷酸基的pK（pK1）与碱基含N环的pK（pK2）决定：pⅠ= (pK1+ pK2)/2。 (强力味精) 3. 肌苷酸及鸟苷酸 5％加入味精，可以使其增鲜30倍 除此，还有很多衍生物，如辅酶UDPG，辅酶A，CTP在磷脂的生物合成中起作用， Ligase 连接酶 3，5磷酸二酯键，3羟基和5羟基 一、DNA的一级结构 脱氧核糖核酸的排列顺序 可以用碱基排列顺序表示 连接键：3’，5’-磷酸二酯键 磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架 碱基形成侧链 多核苷酸链均有5’-末端和3’-末端 DNA的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分子形式。生物界物种的多样性即寓于DNA分子中四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。 （1）同一生物体DNA 分子中嘌呤碱总和=嘧啶碱总和 （2）有种的特异性：同种生物DNA 碱基组成相同，异种生物DNA碱基组成差异很大，可用不对称比率A+T / G+C 的相近程度表示种间亲缘关系的远近。 （3）DNA 碱基组成不受年龄，营养状况及环境的影响。（对维持物种的稳定性起很重要的作用）。 （1）DNA 分子由两条反向平行的多核苷酸链构成双螺旋结构。两条链围绕同一 个“中心轴”形成右手螺旋，螺旋表面有一条大沟和一条小沟。 （2）嘌呤碱和嘧啶碱层叠于螺旋内侧，碱基平面与纵轴垂直，碱基之间的堆集 距离为0.34nm。磷酸与脱氧核糖在外侧，彼此之间通过磷酸二酯键连接，形成DNA 的骨架。糖环平面与中轴平行。 （3）双螺旋的直径为2nm,顺轴方向每隔0.34nm 有一个核苷酸，两个核苷酸之 间的夹角为36°，因此，沿中心轴每转一周有10 个核苷酸。 （4）一条多核苷酸链上的嘌呤碱基与另一条链上的嘧啶碱基以氢键相连，匹配 成对，配对的原则是A=T，之间形成二个氢键，G 三C，之间形成三个氢键。因此DNA 的两条链互补。双螺旋结构见图[P10 2-4,P11 2-5] 注：大多数天然DNA 属双链结构DNA（dsDNA），某些病毒的DNA 是单链DNA（ssDNA）. B型结构 两条链反向平行，右手螺旋 碱基在内（A＝T，G≡C）碱基平面垂直于螺旋轴 戊糖在外，双螺旋每转一周 为10碱基对（bp） A型结构 碱基平面倾斜20o，螺旋变粗变短，螺距2～3nm。 Z型结构 左手螺旋，只有小沟 2、稳定双螺旋结构的力 （1）碱基堆集力 是层层堆集的芳香族碱基上N 原子Π电子云交错而形成的一种 力，使双螺旋结构内部形成一个强大的疏水区，与介质中的水分子隔开，有利于互 补碱基间形成氢键，稳定双螺旋结构。 （2）氢键 互补碱基对之间可形成氢键。DNA 外侧的氧与介质中的水或蛋白质上 的-OH 形成。 （3）离子键 磷酸基团上的负电荷与介质中的阳离子之间形成离子键，减少双链间 的静电排斥力。 其中碱基堆集力是使DNA 结构稳定的最主要因素。 则DNA变性剂（热、pH、脲/酰胺、有机溶剂） 双螺旋DNA进一步扭曲盘绕则形成其三级结构，超螺旋是DNA三级结构的主要形式。自从1965年Vinograd等人发现多瘤病毒的环形DNA的超螺旋以来，现已知道绝大多数原核生物都是共价封闭环(covalently?closed?circle,CCC)分子，这种双螺旋环状分子再度螺旋化成为超螺旋结构(superhelix或supercoil)，如下图所示。有些单链环形染色体(如φ×174)或双链线形染色体(如噬菌体入)，在其生活周期的某一阶段，也必将其染色体变为超螺旋形式。对于真核生物来说，虽然其染色体多为线形分子但其DNA均与蛋白质相结合，两个结合点之间的DNA形成一个突环(loop)结构，类似于CCC分子，同样具有超螺旋形式。超螺旋