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il12a基因snp多态性与口腔扁平苔藓的相关性研究-association between snp polymorphism of il12a gene and oral lichen planus.docx

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il12a基因snp多态性与口腔扁平苔藓的相关性研究-association between snp polymorphism of il12a gene and oral lichen planus

点的基因型及等位基因与OLP有相关倾向,某些等位基因可能是OLP的危险因子[15, 16]。 Xavier[17]发现IL-6-174(G/C)基因型在OLP患者中出现频率很高,相对风险度为6.89,研 究结果同样证实OLP具有遗传基础。Dan[18]研究IL-8基因的4个SNPs,结果显示,-251AA 基因型和-251A等位基因频率在糜烂型OLP中显著降低。-251A/+781C单倍型频率在糜 烂型OLP组明显低于对照组,而-251T/ +781C单倍型频率在糜烂型OLP中与健康对照组 比较明显升高。这项研究表明,IL-8的多态性可能与OLP的严重程度有关。IL-12是新近 发现的Th1类细胞因子,由二硫键连接的p35和p40亚基组成的分子质量为7.5ku的异源二 聚体单核细胞因子(IL-12p70),轻链P35和重链P40分别被编码为IL-12A和IL-12B[19-21] 。 IL-12能增加自然杀伤细胞和T细胞的细胞毒作用,并能促进Th0向Thl分化、活化、增殖, 调节Thl/Th2的比例,增强Thl的生物学功能,进一步促进IL-2、IFN-γ等细胞因子的产生。 已有研究表明,IL-12基因启动子位点的多态性可增加IL-12的产量,且与自身免疫性疾 病的易感性和结局有关。相关文献证实,IL-12A在自身免疫性疾病发病机制中的重要地 位,如多发性硬化症,系统性红斑狼疮,类风湿关节炎等[22-25]。然而,迄今为止,有关 IL-12A基因多态性与OLP发病易感性之间关系的研究,国内外未见明确报道。本项目选择与免疫相关的IL-12A作为遗传标记,应用TaqMan荧光定量PCR法,检 测OLP患者IL-12A多个位点的SNPs,以探讨OLP的疾病易感性、临床类型及药物疗效 与IL-12A基因多态性的关系。2 材料和方法2.1 实验材料2.1.1 主要分子生物学制剂 异丙醇(上海生工生物工程公司) 75%乙醇(上海生工生物工程公司) 超纯水 Tris碱(上海生工生物工程公司) 硼酸(上海生工生物工程公司)Tris-硼酸电泳缓冲液(TBE):浓贮存液(每升),5×:54g Tris碱,27.5g硼酸,20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)使用液,0.5×:0.045mol/L Tris硼酸,0.001mol/LEDTA琼脂糖(Agarose)(美国Promega公司)溴化乙锭,10mg/ml贮存液(上海生工生物工程公司) 95%甲酰胺(Formamide)/1 ml EDTA(illumina公司) XC1、XC2、XC3、XC4(illumina公司) TEM、STM、ATM(illumina公司)100%乙醇 dH2OEDTA 真空抗凝采血管(浙江拱东医用塑料厂)Eppendorf 紫外分光光度计QIAamp DNA Blood Mini Kit(Qiagen,Hilden,德国) Hotstar Taq (Qiagen 美国)384 孔 PCR 板(Applied Biosysterns,美国)384 孔 SNPware 标签微阵列板(Applied Biosystems,美国) The GeneAmp? Gold PCR Reagent Kit (P/N 4312778)the GenomeLab? SNPstream? 12-plex Genotyping System (Beckman Coulter) 全血 DNA 提取试剂盒(QIAamp DNA Blood Mini kit,Qiagen,美国); Hotstar Taq 酶(Qiagen,美国);TaqMan@Universal PCR Master Mix(Applied Biosystems,美国); TaqMan@SNP Genotyping Assay Mix(Applied Biosystems,美国); SBE 纯化酶 (美国 GE Healthcare 公司)2.1.2 主要仪器EPS-300 稳压稳流电泳仪(Tanon);96-孔板(ABgene);台式离心机 5810R/5415R/5415D(Eppendorf 公司) ; 微量移液器(Eppendorf 公司);电子分析天平(METTLER TOLEDO,AB204-E,Switzerland); 纯水器(Millipore,US);凝胶成像系统(Gene 公司);负 80 度超低温冰箱(Heto 公司);Milli-Q 纯水仪(Millipore 公司);微波炉(格兰仕公司);GenomeLabTM SNPstream 平台(BECKMAN COULTER,美国); GenomeLabTM SNPstream@基因分型平台(Beckman Coulter,美国); Ligh

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