扬州大学《现代分子生物学》课件10-基因组和 与比较基因组.pptVIP

第一代多态性标记是RFLP（restriction fragment length polymorphism，限制性片段长度多态性） 第二代多态性标记是短的串联重复序列 包括小卫星DNA和微卫星DNA，其多态性主要来自重复序列拷贝数的变化 小卫星DNA—由15-65bp的基本单位串联重复而成，长度一般不超过20kb。 重复次数（小卫星DNA区的长度）在人群中是高度变异的；按照孟德尔的规律遗传 微卫星DNA/简短串联重复（STR、STRP或SSLP） 重复单元2-8bp，通常重复10-60次 CTAGCTTATATATATATATATATATATATAAGCTTGC 真核生物基因组中的DNA重复序列主要有哪些类型？简要说明基因组重复序列可能的生物学意义以及基因组重复序列在分子标记研究中的应用 （12分）中国科学院2002年 硕士学位研究生入学分子遗传学试题 第三代多态性标记是单核苷酸的多态性 （single nucleotide polymorphism，SNP） SNP：是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。 第一军医大学2003年分子生物学 人类99．9％的基因密码是相同的，而差异不到0．1％，不同人群仅有140万个核苷酸差异。这些差异是由“单一核苷酸多样性”（SNP）产生的，它构成了不同个体的遗传基础。在整个基因组序列中，人与人之间的变异仅为万分之一，从而说明人类不同“种属”之间并没有本质上的区别。 SNP与RFLP和STR标记的主要不同之处在于，它不再以DNA片段的长度变化作为检测手段，而直接以序列变异作为标记。 2、物理图 以已知核苷酸序列的DNA片段（序列标签位点，sequence-tagged site,STS）为“路标”，以碱基对作为基本测量单位（图距）的基因组图。 * 第十章　基因组与比较基因组学 20世纪人类科技发展史上的三大创举 90年代人类基因组计划 40年代第一颗原子弹爆炸 60年代人类首次登上月球 人类基因组计划 ＤＮＡ的鸟枪法序列分析技术 比较基因组学及功能基因组研究 Contents 一、人类基因组计划的启动 1986 年诺贝尔奖获得者R.Dulbecco（杜尔贝科）提出人类基因组计划—— 测出人类全套基因组的 DNA 碱基序列（ 3 X 109 bp ） 第一节　人类基因组计划 1975年，获诺贝尔生理医学奖 二、人类基因组计划的进展状况（1）截至 1998 年 10 月，完成 1.8 X 108bp，占 计划的 6％。（2）完成一系列模式生物全基因组测定。 这些模式生物全基因组测定的完成有重大理论与现实意义。 （3）DNA 测序技术飞速提高 1998.5.9 J.C. Venter 等宣布，组建商业公司，投入 3 亿美元，3 年内完成。 接着又有若干家公司成立， 总共投入资金约几十亿美元， 形成  “公”“私”并进 格局 2000.6 完成并公布 人类基因组工作框架图( 90%)。  二000年六月二十六日克林顿宣布 人类基因组草图绘制完成 美国国家人类基因组研究所所长弗朗西斯·柯林斯在介绍情况。 人类基因组草图基本信息 由31.65亿bp组成 含3~3.5万基因 与蛋白质合成有关 的基因占2% 人类基因组 人类蛋白质 61%与果蝇同源 43%与线虫同源 46%与酵母同源 2000年6月公共领域测序计划工作框架图 2000 年 12 月美、英等国科学家宣布绘出拟南芥基因组的完整图谱，这是人类首次全部破译出一种植物的基因序列。 2001 年2月16日 人类基因组“精细图”完成，(99%), 同时发表论文 美国 Science, Vol. 291, No. 5507  英国Nature , Vol.409, p.860 DAN测序胶图 ２００３年４月１４日，人类基因组序列图亦称“完成图”（99.99%），提前绘制成功。 三、人类基因组计划的科学意义 （1）确定人类基因组中约数万个编码基因的序列及其在基因组中的物理位置，研究基因的产物及其功能。 （2）了解转录和剪接调控元件的结构与位置，从整个基因组结构的宏观水平上理解基因转录与转录后调节。 （3）从整体上了解染色体结构，包括各种重复序列以及非转录“框架序列”的大小和组织，了解各种不同序列在形成染色体结构、DNA复制、基因转录及表达调控中的影响与作用。（4）研究空间结构对基因调节的作用。有些基因的表达调控序列与被调节基因从直线距离上