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- 2018-06-05 发布于贵州
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第十九章氨基酸蛋白质和核酸 ppt课件
组成DNA的核苷酸 脱氧腺苷酸(dAMP) 脱氧鸟苷酸(dGMP) 脱氧胞苷酸(dCMP) 脱氧胸苷酸(dTMP) HOH2C H H H O O OH H N N N N NH2 H O P O O H 腺苷-3’-磷酸 例如: 腺苷-5’-磷酸 三、核酸的结构 H H H OH O OH H N N N N NH2 HO P OH2C OH O DNA一级结构片段 A C G T H H H O H H N N N N NH2 O OH P OH2 C O H H H O H NH2 H N N O O P OH2 C OH O O P OH2 C OH O H H H O H N N N N NH2 O H O P OH2 C OH O H H H O H H N N O O H H3 C H DNA一级结构片段简化式 P P P P 1 1 1 1 3 3 3 3 5 5 5 5 A C G T 和蛋白质类似,核酸除了一级结构外,还有二级、三级、四级等复杂的空间结构。例如,DNA的二级结构是由两条反向平行的DNA链,沿着一个中心轴向右盘旋成的双螺旋结构,两条链通过嘧啶碱基和嘌呤碱基的氢键两两配对。但是两条链间碱基的配对不是随意的,只能是A和T形成两个氢键,C和G形成三个氢键,这种碱基配对规则称为碱基互补规则。 胸腺嘧啶(T) 腺嘌呤(A) T A N N H O O H3C H N N N N N H 脱氧核糖 脱氧核糖 胞嘧啶(C) 鸟嘌呤(G) 脱氧核糖 脱氧核糖 N N O H N N N N N H N H O H C G H Complementary Base Pairing in DNA Double Helix 2. 命名 命名原则:C-端氨基酸为母体,其它从左到右以某氨酰表示。例如: 甘氨酰丙氨酸(Gly-Ala) 丙氨酰甘氨酸(Ala-Gly) 两种中性氨基酸分子间脱水可生成两种二肽,n种中性氨基酸有n! 种结合方式。 谷氨酰半胱氨酰甘氨酸 (谷胱甘肽) *3. 结构 肽键中的p?π使C—N具有部分双键的性质,其键长介于单键键长C—N (0.149nm)和双键键长(0.127nm)之间,约0.132nm。 C N O O C N X射线衍射法测定表明,组成肽键的六个原子共平面。羰基碳原子的三个键之间的夹角和氨基氮三个键之间的夹角都接近120°。由于共轭效应,肽键中的C—N键不能自由旋转,所以存在顺反两种可能的构型: 顺式构型 反式构型 在蛋白质中以反式构型存在,反式构型在能量较稳定。 C N O C H C C N O C H C 肽的几何形状 *二、多肽结构的测定 1. 多肽组成的测定 一定质量的多肽试样 → 酸水解 → 离子交换柱色谱法分离 → 水合茚三酮显色 → 定性,定量 → 根据多肽相对分子质量和所含氨基酸的种类,确定各种氨基酸分子的数目——全自动氨基酸分析仪的测定原理。 2. 氨基酸顺序的测定 多肽链中氨基酸的排列顺序(N-端 → C-端)称为氨基酸顺序,是多肽和蛋白质最重要的特性之一。 特定的酶→肽链部分水解→较小的片段→端基分析法测定每个小片段中氨基酸的排列顺序→逐步确定整个多肽链中氨基酸的排列顺序。 在N-端引入具有特定基团的标记化合物,这种标记基团有颜色、荧光、紫外吸收等性质,然后分离鉴定具有这种基团的氨基酸衍生物。 重点讨论N-端氨基酸单元的分析 (1)Sanger(桑格尔)法 2,4-二硝基氟苯(DNFB) 肽的DNP衍生物 DNP-N-端氨基酸(黄色) R O2 N NO2 HNCHCONHCHCO R H2O/H + O2N NO2 HNCHCOOH R R + H2 NCHCOOH + ...... R R F NO2 O2 N R + H2 N CHCONHCHCO R 2,4-二硝基氟苯与多肽链中的N-端氨基酸反应,在N-端生成DNP衍生物,然后在酸中水解,肽键断类,但DNP键保留,仍留在N-端氨基酸上。DNP-N-端氨基酸为黄色,很容易和其它氨基酸分离和鉴定。 (2)Edman(
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