丙型肝炎病毒基因型的研究进展(期刊)..pdfVIP

安 徽 医 药 AnhuiMedicalandPharmaceuticalJournal 2009Aug；13(8) ·869 · 丙型肝炎病毒基因型的研究进展 徐少保 ，熊 自忠。，高人焘 ，沈 强 (1．安徽医科大学附属省立医院感染病科，安徽 合肥 230001；2．安徽医科大学第一附属医院感染病科 ，安徽 合肥 230022) 关键词 ：丙型肝炎病毒；基因型 有已知的亚型和描述新的变异 ，目前仍为，HCV基 因分型的 “金标准”。但是操作繁琐，成本较高，对混合感染不易确定。 丙型病毒性肝炎 (viralhepatitisC)是一种主要经血液传 型特异性 RT-PCR方法成本较低，不需要特殊设备，是通过对 播、由丙型肝炎病毒 (hepatitisCvirus，HCV)引起的肝脏急、 套式 RT—PCR引物设计的优化，使扩增片断大小不同，达到分 慢性炎症性疾病。目前 ，全世界丙型肝炎感染率为3％，由此 型 目的。此方法可将6个基 因型完全分开，并可以区分混合 推算约有 1．7亿 ～2．0亿人为丙型肝炎病毒 (HCV)感染 感染。缺点是有时会 出现较弱的扩增条带，难以判断。针对 者…，每年新增感染者约为350万人。在我国，丙型肝炎主要 HCV基因分型方法的不足，各 国学者都在通过不同角度改 通过输血传播 ，感染总人数超过5000万人 ，属 HCV的中 进，新方法也不断出现，如型特异性探针杂交法、基因芯片法、 高度感染区。HCV基因分型与病程发展和干扰素治疗应答 限制性片断长度多态性 (RFLR)法、荧光共振能量转移探针 有一定相关性。本文就丙型肝炎基因型的目前国内外研究进 的解离曲线分析法、异源分子迁移率分析(HMA)法以及应用 展综述如下。 人工合成的血清型特异性肽段经酶免法检测等。邱 国华 1 丙型肝炎病毒概述 等 通过对限制性片断长度多态性(RFLR)法方法的改进 ， 1．1 HCV的基本分子生物学特性 丙型肝炎病毒 (HCV) 建立了ABC酶切三步法，适用于我国感染人群检查，但不足 属黄病毒科 ，为单股正链 RNA病毒，球形 ，有包膜 ，全基因组 是技术流程相对比较复杂。需要指出的是 ，上述各种方法所 大小t。在3’末端有一个 “多肽A尾巴”，核酸序 得结果会有一定差异。一些方法 目前只是实验室方法，还没 列包含有由341个碱基组成的5’非翻译 区，一个含3O11个 有商品试剂供应。 氨基酸的多肽蛋 白的巨大的开放读码框架 (Openreading 3 丙型肝炎病毒的基因型的地理分布特征 frame，ORF)和由约27个碱基组成的3’非翻译区。ORF编码 HCV基因型分布存在地理性差异。基 因型 la是第一个 一 个大的前体蛋白，此蛋 白可被宿主和病毒蛋白酶加工成结 被鉴定的序列 ，多见于美国，基因型 1b广泛分布于亚洲各国， 构蛋 白(Core、E1、E2和 p7)和非结构蛋 白(NS2—5)。5’UTR 同时在美国、欧洲、中国和 日本的感染病例也较高。基因型 区最为保守，核糖体进入位点位于该区；而 3’UTR对于 2a和2b占全球 HCV基 因型的10％一30％，遍布在北美、欧 HCVRNA复制是不可缺少的 。由于 HCV的复制所依赖的 洲、中国和 日本等地，而基因型2c仅在意大利北部发现。基 RNA聚合酶缺乏3’-5’核酸外切酶校正功能，致使其基因组 因型3在印度半岛、东南亚和印度尼西亚较为突出，其中基因 发生突变的频率较高，从而更容易逃避机体的免疫识别或者 型3a特别在北欧、美国地区的药物注射者中流行 ，通常混合 抑制宿主，易发生突变 J。 感染基因型1aJ。基因型4分布在非洲 中北部和地中海东 1．2 HCV的基因型及命名 HCV基因组呈现高度异质性 ， 部国家 (埃及、意大利)。基 因型 5在南非 占主