一些生物大分子体系的实际化学研究.pdfVIP

摘要 摘要 生物大分子体系的研究能够加深人们对生命过程的认识，也能够提高人 类对生物大分子的综合利用。因此深入研究木质素的生物合成的机理以及HDV 核酶自切除反应的机理是当前生物物理有机化学、化学生物学、生物医学等领域 中最热门的前沿课题之一。但由于实验条件和研究对象的限制，采用量子理论化 学方法就显得非常必要。这些课题会为生物质热解为生物油的研究，以及HDV 核酶的基因治疗提供了有价值的理论指导。 本论文对术质索单体的键离解能、气态电离能、水溶液中的氧化电动势等物 理化学性质进行了深入的研究；对HDV核酶自切除反应的机理进行了详细的研 究，本文的主要研究工作如下： 。通过结合密度泛函的方法以及与实验数据，经过对数据的线性拟合，能 够精确的预测不同木质素单体的相对和绝对键离解能、气态电离能、水溶液中的 氧化电动势，精度达到2kcal／mol，同时通过木质素单体在水溶液中的氧化电动 势的研究，找到了木质素生物合成的反应过程和反应机理。为精确预测酚类化合 物的物理化学性质提供了可行性，为小质素的研究提供了有益的理论指导。 率先尝试将分子动力学、量子力学反戍路径搜索、量子力学与分子力学 组合(QM，MM)、自由能微扰、NAC、p蚝、表观活化能等概念相结合应用于HDV 核酶的自切除反应机理的研究。我们最终确定了在科学界争论了20多年的HDV 核酶自切除反应的机理。为萃因治疗肝病毒提供了有益的理论指导。 同时这一套方法无论从机理的解释还是从数据的精度上来讲，都将优于 以往一种或者两种方法相结合的计算，可以将这一套方法扩展剑其他生物大分子 体系的研究。拓展了物理有机化学研究方法和研究领域。 基于量子化学理论方法的第一性原理，其计算结果是可靠的，同时它不受实 验条件的限制，可以解决一些通过实验手段难以解决的问题。本论文的研究成果， 会对生物质洁净能源的研究以及HOV核酶的基因治疗提供有价值的基础资料。 摘要 关键词：木质素，核酸，核苷，自由基，自切除反应，键离解能，气态电 离能，氧化电动势 II AbStraCt TheresearchesOn BiOmacrOmOIeCuIescan Our deepenunderStanding OfIife aIsOcan science。and the Of biOmacnomoleculeS． imprOveapplicatiOns S0theresearchesOnthe mechanismsOf andthe IignjnbiOsynthesis nlechanismsOf reaclionOfHDV areOneOf self：cleaVing r_bOzyme thehot directionsin and biOphysical0rganicchemislry， biOmedicine biOchemjstry areas．AStheIimitallonOf cOnditiOnSan