大学生物遗传学:第七讲真核基因表达调控PPT
2. DNA结合蛋白主要转录激活结构域 转录激活结构域(transcription activation domains)一般由20-100个氨基酸残基组成。如GAL4分子中有2个这种结构域,分别位于多肽链的第147-196位和第768-881位;GCN4的转录激活结构域位于多肽链的第106-125位。 a. 酸性α-螺旋(acidic α-helix)该结构域含有由酸性氨基酸残基组成的保守序列,多呈带负电荷的亲脂性α-螺旋,包含这种结构域的转录因子有GAL4、GCN4、糖皮质激素受体和AP-1/Jun等。增加激活区的负电荷数能提高激活转录的水平。可能是通过非特异性的相互作用与转录起始复合物上的TFIID等因子结合生成稳定的转录复合物而促进转录。 b. 谷氨酰胺丰富区(glutamine-rich domain)SP1的N末端含有2个主要的转录激活区,氨基酸组成中有25%的谷氨酰胺,很少有带电荷的氨基酸残基。酵母的HAP1、HAP2和GAL2及哺乳动物的OCT-1、OCT-2、Jun、AP2和SRF也含有这种结构域。 C.脯氨酸丰富区(proline-rich domain)CTF家族(包括CTF-1、CTF-2、CTF-3)的C末端与其转录激活功能有关,含有20%-30%的脯氨酸残基。 3. 与已知DNA序列相结合的反式作用因子 a. CAAT盒激活因子 CTF(CAAT box transcription factor)家族是能识别CAAT盒的一组转录因子。这一组因子是由单个基因通过可变换的剪接而形成的一组mRNA产生的。CTF家族成员对各种CAAT盒有相同的亲和力。另一组CAAT区结合蛋白被称为CP,它们是从人的HeLa细胞中得到的。CP1具有对α-球蛋白和腺病毒晚期基因启动子CAAT区的高亲和力,CP2具有对γ-血纤蛋白原基因启动子CAAT区的高亲和力,而CP3能与腺病毒DNA相结合。CP族蛋白主要以异源多聚体的形式存在。 除了CTF和CP族蛋白能与CAAT区结合外,科学家还从小鼠肝细胞里发现两个CAAT区结合蛋白。CBP对序列GCAAT有较强的亲和力,而ACF则对卵清蛋白基因启动子区的CCAAT有高亲和力。因此,在启动区发现某个保守序列,并不等于同一个蛋白因子参与了该基因的调控。 对9个哺乳动物类β-球蛋白基因和1个人α-球蛋白基因5调控区的研究发现,几乎每个基因都具有CCAAT(-80位左右)区和TATA(-30左右)区。? b. TATA区结合蛋白 RNA聚合酶II需要与其他转录因子结合,才能顺利起始转录。通常把辅助因子需要量最小的启动子称为一般性启动子(generic promoter),具有组成型表达特性,这些启动子上游调控区及所需转录因子在绝大多数甚至全部基因中都是高度保守的。 TBP结合于DNA的小沟。TBP与DNA的结合在体外实验中保护 了大约一圈双螺旋DNA免受核酸酶的降解,其覆盖的位置处于 -37~-25。TAFs的加入延伸了对DNA的覆盖,整个TFIID复合 物可覆盖-45~-10区域。 C. GC区结合因子 ? GC区结合蛋白SP1是1.0x105的单体,能与DNA链上包括GGGCGG在内约20bp的序列特异结合。在SV40启动子区,从-70~-110的6个GC区全部与SP1结合,所以这个区域的DNA不会被降解。在胸腺嘧啶激酶启动子区,SP1既与上游的CTF(CAAT区结合蛋白)相互作用,又与下游的TFIID紧密相关。? ? GC区对SP1的结合是必需的,但该序列对于SP1亲和力却很不相同,证明GC区两翼序列同样在SP1的识别及结合过程中发挥作用。人们推测GC区、尤其是多次重复的GC区,与基因的永久型表达有关。 d. 八碱基对元件激活蛋白 ? 八碱基对元件也能被多个激活蛋白识别。Oct-1是非淋巴样细胞中结合八碱基对元件的转录激活因子,没有组织特异性。 Oct-2则是组织特异的激活因子。 ? 一般说来,一个特定的共有序列元件能被相应的转录因子或一个转录因子家族的成员所识别,而相同的元件也能被不同的转录因子所识别。 五、真核基因转录后加工的多样性 1.简单转录单位 2. 复杂转录单位 含有复杂转录单位的主要是一些编码组织和发育特异性蛋白质的基因,它们除了含有数量不等的内含子以外,其初级转录产物能通过多种不同方式加工成两个或两个以上的mRNA。 利用多个加poly(A)位点和不同的剪接方式产生不同的蛋白质。这类基因5末端虽只有一个转录起始位点,但有两个或多个加poly(A)位点,因此可通过不同的剪接方式得到
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